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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003478`

染色体: Chr08 坐标: 37395912-37397283 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003478`
名称	SmilChr08G003478
描述	uncharacterized SmilChr08G003478
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37395912 - 37397283 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996602`
GeneID	`130996602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996602`
原始查询	`LOC130996602`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=57.7; qcov=0.248; evalue=8.8e-37; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=50.6; qcov=0.979; evalue=6.46e-144; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777882.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057777882.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057777882.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777882.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777882.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37395924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:37396033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B95,C8
`Chr8:37396056`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B110,B95,C48,C8
`Chr8:37396056`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B110,B95,C48,C8
`Chr8:37396058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B95,C48,C8
`Chr8:37396087`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	54	A1,A15,A23,A25,A6,A8,B1,B104,B109,B114,B117,B118,B120,B122,B123,B126,B137,B140,B18,B2,B20,B25,B29,B39,B41,B43,B48,B57,B60,B61,B71,B75,B78,B80,B81,B86,C21,C23,C24,C28,C40,C45,C51,C62,C64,C65,C74,C77,C78,C82,C83,D10,D2,D5
`Chr8:37396150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,C18,C48,C63,C8
`Chr8:37396249`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A23,A25,A5,B118,B2,B86,C12,C17,C23,C28,C51,C78,C87,D10,D2,D5
`Chr8:37396251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C15,C64
`Chr8:37396294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr8:37396320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:37396406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777882.1

420 aa

210

420

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 35-73 aa PF04827 Plant_tran 143-345 aa PF13359 DDE_Tnp_4 172-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777882.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	35	73	1.6e-15	57.2	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057777882.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	143	345	3.3e-106	354.1	Plant transposon protein
`XP_057777882.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	172	335	9.7e-12	45.5	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921899.1
AAATAACAACTTTGATGATAGTTCAAGTTCAACCTTTGATCCTTTCGACTTCACCGAATTTGATGAATGGCATGAACGCCTTACATTACGAAATCGAACACTTGACTCCATGATAGAGGATGTTGCTTTCAGCATTCCAACTCTATCCCTACAACCTACAAACCACACAAATAGAGCCCGACGACGATTCATTGAACGACAACGTGAGAAGGGCCATGAAGGTGTGTTCGAGCAATACTTTTCTGACGAACCGATCTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996602
ATGATAGAGGATGTTGCTTTCAGCATTCCAACTCTATCCCTACAACCTACAAACCACACAAATAGAGCCCGACGACGATTCATTGAACGACAACGTGAGAAGGGCCATGAAGGTGTGTTCGAGCAATACTTTTCTGACGAACCGATCTACACTCCAGAAGTTTTTCGAACCAGATTTCGCATGCGAAAGCCATTATTCGAACGGATAATGAGCAAACTCGTTGCTACCGACCAATTTTTTCAACAAAATCGTGATGCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777882.1
MIEDVAFSIPTLSLQPTNHTNRARRRFIERQREKGHEGVFEQYFSDEPIYTPEVFRTRFRMRKPLFERIMSKLVATDQFFQQNRDAAGRLGMSSIQKCTAAMRVLAYGTGADLHDEYLRMSAQTIRRSVEKFVEGVINNFGDEYLRKPNEEDLSYLLHVGEQRGFPGMLGSIDCMHWEWKNCPTAWAGQYAGRNGKATIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGSRNDINVLEQSPVFKDILEGRAPEVSYVVNGHEKNMGYYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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