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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003489`

染色体: Chr08 坐标: 37517797-37522859 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003489`
名称	SmilChr08G003489
描述	uncharacterized SmilChr08G003489
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37517797 - 37522859 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996608`
GeneID	`130996608`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996608`
原始查询	`LOC130996608`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01130` (AT5G01130) - identity=27.5; qcov=0.963; evalue=4.59e-38; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=31.7; qcov=0.667; evalue=6e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996608

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777885.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777885.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777885.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777885.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777885.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37517892`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B34,B7,C20,C30,C71
`Chr8:37517892`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B34,B7,C20,C30,C71
`Chr8:37517894`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B34,B7,C20,C30
`Chr8:37517894`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B34,B7,C20,C30
`Chr8:37517937`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A2,A7,B10,B107,B121,B15,B20,B35,B42,B55,B67,B76,B80,B81,B98,C12,C29,C31,C32,C5,C52,C63,C68,C79
`Chr8:37517968`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A20,B117,B139,B22,B46,B64,C11,C28,C74,C75
`Chr8:37517971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B58,C54,D10
`Chr8:37518002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B94,D4
`Chr8:37518038`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A9,B120,B22,B65,B85,C64
`Chr8:37518041`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A9,B120,B22,B65,B85,C64
`Chr8:37518071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B130,C34,C74,C75
`Chr8:37518090`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B1,B117,B124,B125,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777885.1

483 aa

242

483

DUF674

PF05056 DUF674 9-427 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777885.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	9	427	1.8e-79	268.4	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921902.1
TGTCTTTGCCATTGTAGAACCAAACATGAGGTCTGCAATACCCAAGGATGTAAAGATGTCCCTTAAAGTTATGGTGAATAAAGAGAAAACAAAGGTTCCATTTGCAGAAGCCAACAGCAAATCTGCAGAGGTTATACTAAGTTTTCTGATGTTGCCATTGGGGGAGATTGTGAGGGTCTTCGAGGAGCATTATTTGGATAAGAAACCCGTTGTTGGAAGCTTAACACCGATGTATAGGCACTTAACAACTCTTCGTAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996608
ATGAGGTCTGCAATACCCAAGGATGTAAAGATGTCCCTTAAAGTTATGGTGAATAAAGAGAAAACAAAGGTTCCATTTGCAGAAGCCAACAGCAAATCTGCAGAGGTTATACTAAGTTTTCTGATGTTGCCATTGGGGGAGATTGTGAGGGTCTTCGAGGAGCATTATTTGGATAAGAAACCCGTTGTTGGAAGCTTAACACCGATGTATAGGCACTTAACAACTCTTCGTAGTGACTATTTCTGGACAGATGGTGGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777885.1
MRSAIPKDVKMSLKVMVNKEKTKVPFAEANSKSAEVILSFLMLPLGEIVRVFEEHYLDKKPVVGSLTPMYRHLTTLRSDYFWTDGGKNMLLNPSNSFMSGPVKHFRCGDMDCKKKSFRNVSIYYDSGTCDCGKPLNRAMGEIEPKPQAGGDGILVEGLHFLVTDDLQLAPYEPGSMMETLVYLGIVVTEGAEQLNVTLGYNEIVDLLKRSLLSKTPLTDVILCVINKNMGYVLEDILLDKIELESTSSKRMTVTALMQKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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