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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003499`

染色体: Chr08 坐标: 37556947-37558704 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003499`
名称	SmilChr08G003499
描述	uncharacterized SmilChr08G003499
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37556947 - 37558704 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996613`
GeneID	`130996613`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996613`
原始查询	`LOC130996613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G09140; symbol=AT3G09140; hit=AT3G09140; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT3G09140; symbol=AT3G09140; hit=AT3G09140; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09140` (AT3G09140) - identity=28.8; qcov=1.06; evalue=4.92e-51; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=28.6; qcov=0.753; evalue=2.08e-38; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996613

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777892.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777892.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777892.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777892.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777892.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37557164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr8:37557332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D9
`Chr8:37557332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr8:37557333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr8:37557361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B140,B30,B8,C13
`Chr8:37557431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B43,C73,C9
`Chr8:37557511`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B76,C9
`Chr8:37557511`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B76,C9
`Chr8:37557514`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B76,C9
`Chr8:37557514`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B76,C9
`Chr8:37557536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C9
`Chr8:37557549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B140,B47,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777892.1

469 aa

234

469

DUF674

PF05056 DUF674 8-434 aa PF05056 DUF674 385-464 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777892.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	8	434	6.5e-99	332.5	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057777892.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	385	464	6.5e-99	332.5	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921909.1
AATGGCTGATGATAAAAAAGGTGCGACATTTTCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACTAAGGTGCTCTTCGCAGACTCCGACAGCCATTTTGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGAGTTTGCCATTGGGAAGAATTGTGAAAGTCCTCGAGAAGCACTATGGAGACGAGGCGCCTACCATTGGTAGCTTAAGCAGTTTGTACCGTAGCTTAGTAAATCTCGACAGTGCATATTTCTGGACTGATGGAGCTAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996613
ATGGCTGATGATAAAAAAGGTGCGACATTTTCGTTGAAAGTGATGATCAATAAAGAGAGAACTAAGGTGCTCTTCGCAGACTCCGACAGCCATTTTGCAGACATTTTGTTAAGCTTCTTGAGTTTGCCATTGGGAAGAATTGTGAAAGTCCTCGAGAAGCACTATGGAGACGAGGCGCCTACCATTGGTAGCTTAAGCAGTTTGTACCGTAGCTTAGTAAATCTCGACAGTGCATATTTCTGGACTGATGGAGCTAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777892.1
MADDKKGATFSLKVMINKERTKVLFADSDSHFADILLSFLSLPLGRIVKVLEKHYGDEAPTIGSLSSLYRSLVNLDSAYFWTDGAKQTLLDPTSSLEDEYRRLKLDIADFQPAEYFSCSNTQYHIPSYRFRSVGIYYDHIKRCKICSFGIFIKEVAKKGSEAAASRDGVFTMNTSSFIISDDLHIFPNETGLLGVISFLGITDMDNAEQIKVDLGFTEIMNLLKASLTSPTPLSDIILNKTTQLVNSKFMVTQPHTTEEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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