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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003503`

染色体: Chr08 坐标: 37580970-37583140 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003503`
名称	SmilChr08G003503
描述	uncharacterized SmilChr08G003503
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37580970 - 37583140 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996619`
GeneID	`130996619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996619`
原始查询	`LOC130996619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01150; symbol=AT5G01150; hit=AT5G01150; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01150; symbol=AT5G01150; hit=AT5G01150; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01150` (AT5G01150) - identity=29.9; qcov=1.07; evalue=1.62e-50; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=29.6; qcov=0.803; evalue=1.11e-37; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777900.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777900.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777900.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777900.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057777900.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37581044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B37,C8
`Chr8:37581051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B55,B58,C40
`Chr8:37581074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:37581086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B41,B59,B98,C61
`Chr8:37581321`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B125,B137,B4,B54,B58,B75,B95,C29,C38,C50
`Chr8:37581384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B26
`Chr8:37581454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:37581472`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A22,B10,B22
`Chr8:37581472`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A22,B10,B22
`Chr8:37581482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B41,B98,C61
`Chr8:37581489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B7
`Chr8:37581564`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A24,B54,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777900.1

458 aa

229

458

DUF674

PF05056 DUF674 6-360 aa PF05056 DUF674 372-451 aa

XP_057777901.1

458 aa

229

458

DUF674

PF05056 DUF674 6-360 aa PF05056 DUF674 372-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777900.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	6	360	4.8e-86	290.1	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057777900.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	372	451	4.8e-86	290.1	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057777901.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	6	360	4.8e-86	290.1	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057777901.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	372	451	4.8e-86	290.1	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921918.1
AGCTTTCAGAGCAAGCTTGAAGCTGCGACCATAATTTACTGTTCCAAGTTTTCAGAGCAAAGCTTGAAGCTACTTTTTTTCTATATTCCACTCGCCACCGCTTCTCGCCCTCCCGACTGCCACCGGAGCTCCGCCGCGCTCAGCCACCGTCTGCTGCGTTTTTTTCCATATCTCAGGCTCCACGCCATCCTATTTTCATCAAAAACCTCTGTTGTCGAGCTTCACTCGCCGAATCGCCGAAAATGTCTGATGCTGAAGAA...

XM_057921917.1
AGCTTTCAGAGCAAGCTTGAAGCTGCGACCATAATTTACTGTTCCAAGTTTTCAGAGCAAAGCTTGAAGCTACTTTTTTTCTATATTCCACTCGCCACCGCTTCTCGCCCTCCCGACTGCCACCGGAGCTCCGCCGCGCTCAGCCACCGTCTGCTGCGTTTTTTTCCATATCTCAGGCTCCACGCCATCCTATTTTCATCAAAAACCTCTGTTGTCGAGCTTCACTCGCCGGTAACCCTAATCCCCTTTCCTCTGTGATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996619
ATGTCTGATGCTGAAGAAGTAAAGGTCTCACTGAAAGTGATGATGAACAAACAGAAATCCAAGGTGCTATTTGCAGAATCCGACAGCGATTTTGTAGACATTTTGTTGAGCTTCTTGACTTTGCCGTTGGGAAGAACTGTGAAAGTTCTGGAGAAACACTACGGAGATGAGGCACCCACCATTGGAAGCTTAAACAATTTGTACCGCAGCTTAGCAAATCTTGACAGCTCCCATTTTGTGACGGAGGGTGCTAAGCAGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777900.1
MSDAEEVKVSLKVMMNKQKSKVLFAESDSDFVDILLSFLTLPLGRTVKVLEKHYGDEAPTIGSLNNLYRSLANLDSSHFVTEGAKQTLLDSASSFEDKYKMLKVDISDSPPAEYFVCSSCANRRLRCESIYYDSISCYYCEDTMSKEVVEKSCEADGRSDGVFTKHTSSFLISNDLHILPKNARFLTTVGILGITVTDMDNAVSIKVDFGISEIMKLLKASLMSPTPLSDLILNKTTTLMNNMTPVVESRSNHSSKYFSV...

XP_057777901.1
MSDAEEVKVSLKVMMNKQKSKVLFAESDSDFVDILLSFLTLPLGRTVKVLEKHYGDEAPTIGSLNNLYRSLANLDSSHFVTEGAKQTLLDSASSFEDKYKMLKVDISDSPPAEYFVCSSCANRRLRCESIYYDSISCYYCEDTMSKEVVEKSCEADGRSDGVFTKHTSSFLISNDLHILPKNARFLTTVGILGITVTDMDNAVSIKVDFGISEIMKLLKASLMSPTPLSDLILNKTTTLMNNMTPVVESRSNHSSKYFSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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