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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003530`

染色体: Chr08 坐标: 37902318-37903030 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003530`
名称	SmilChr08G003530
描述	uncharacterized SmilChr08G003530
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37902318 - 37903030 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996648`
GeneID	`130996648`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996648`
原始查询	`LOC130996648`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820175]; symbol=AT3G10120; hit=AT3G10120; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820175]; symbol=AT3G10120; hit=AT3G10120; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G10120` (AT3G10120) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820175] identity=41.3; qcov=0.79; evalue=4.87e-33; confidence=medium
Rice	`Os11g0153000` - identity=55.6; qcov=0.199; evalue=2.37e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14009 (PADRE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996648

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057777924.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057777924.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057777924.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057777924.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777924.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37902390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A21,A22,B115,B120,B137,B139,B18,B20,B23,B76,B86,B88,C16,C18,C23,C31,C44,C54,C75,C81,C82,C86
`Chr8:37902421`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A15,A7,B11,B120,B124,B135,B136,B25,B33,B38,B39,B45,B52,B59,B65,B66,B67,C1,C21,C27,C50,C55,C6,C60,C73,D11
`Chr8:37902474`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr8:37902474`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr8:37902709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:37902760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B15,C22,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777924.1

181 aa

181

PADRE

PF14009 PADRE 40-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777924.1`	Pfam	`PF14009`	PADRE	Domain	40	152	1.9e-16	61.7	PADRE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921941.1
AAACTATGAGGGCATCCTCATCTCTTTCCCCAATATATATACCACCAACATATTTATTTACATCTCTCACTTGGCAAATTTCAACTTCTATTCCTCATTCTCAGACACAAAGCAAAACAAAAATGGGAAACTGCTTAGTTGTTGAGCAGAAATCTGTGAGTGTAATGAAAACAGATGGGAAGATCATTGAGTACAAATCCCCCATCAGAGTCCACCAGATTCTGTCTGAATTTTCTCACCATGCAATCTCTGATAAACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996648
ATGAGGGCATCCTCATCTCTTTCCCCAATATATATACCACCAACATATTTATTTACATCTCTCACTTGGCAAATTTCAACTTCTATTCCTCATTCTCAGACACAAAGCAAAACAAAAATGGGAAACTGCTTAGTTGTTGAGCAGAAATCTGTGAGTGTAATGAAAACAGATGGGAAGATCATTGAGTACAAATCCCCCATCAGAGTCCACCAGATTCTGTCTGAATTTTCTCACCATGCAATCTCTGATAAACTCCCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777924.1
MRASSSLSPIYIPPTYLFTSLTWQISTSIPHSQTQSKTKMGNCLVVEQKSVSVMKTDGKIIEYKSPIRVHQILSEFSHHAISDKLPVVKHLHPNTELLGGRLYYLLPLPAAPQPAKKKKRVRFSEDVVEEERRRATGAVRIKLVITKQELQAMLAKKGVSVEQMISQVQKEPLKIDSIPPL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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