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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003543`

染色体: Chr08 坐标: 38068454-38072202 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003543`
名称	SmilChr08G003543
描述	ABC transporter B family member 29, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38068454 - 38072202 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996656`
GeneID	`130996656`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996656`
原始查询	`LOC130996656`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter B family member 29, chloroplastic
产物	ABC transporter B family member 29%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G03910` (ABCB29) ABC2 homolog 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830269] identity=61.7; qcov=0.91; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0413000` (OsABCB27) - identity=45.4; qcov=0.936; evalue=4.87e-153; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF00664 (ABC_membrane)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996656

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057777936.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057777936.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057777936.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777936.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38068640`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B120,C1,C50
`Chr8:38068640`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B120,C1,C50
`Chr8:38069042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B91,D10
`Chr8:38069475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C46
`Chr8:38069723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:38069864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B17
`Chr8:38070125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:38070644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:38070695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C42
`Chr8:38071641`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr8:38071641`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr8:38071730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777936.1

622 aa

311

622

ABC_membrane

ABC_tran

PF00664 ABC_membrane 85-342 aa PF00005 ABC_tran 406-557 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777936.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	85	342	6.1e-20	72.7	ABC transporter transmembrane region
`XP_057777936.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	406	557	1.7e-34	120.0	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921953.1
GATGCCGGGAAAGAAAAGGAAAAGCAAAAAACAAATTCAGTTATGACAGTTGATACCGAAGTTGTTTTATAAGTCAGCCTCCGAGGCTGTCCCAACTTCTCCCTCAGCCTGAGCTTCAACAGACATCCATGGCACAATTTCTCCAATTTCCGCCGCCATACTCTTCATCTTCACTCTTCCACAACAACCTCAAGATCCTCGCTCGATATCGCAAAATTTCCATCCTAAATCATGGCCGAATCCGCTCGCCCGCGGCTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996656
ATGGCACAATTTCTCCAATTTCCGCCGCCATACTCTTCATCTTCACTCTTCCACAACAACCTCAAGATCCTCGCTCGATATCGCAAAATTTCCATCCTAAATCATGGCCGAATCCGCTCGCCCGCGGCTGCTTGCAGCTACCGCCCCCCGCCGATCAAATTCGCGCCCCTCACGGCACTGTCGCCCTACCTCCAATCGGAATGGCGGGCGATCCTCAGCGGCTGGCTATGCAGCGCCGTTTCGGTTTACTCGCTCTCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777936.1
MAQFLQFPPPYSSSSLFHNNLKILARYRKISILNHGRIRSPAAACSYRPPPIKFAPLTALSPYLQSEWRAILSGWLCSAVSVYSLSKLVPLAGQLSSSITISNLASVRNGALALGILLLIRIVANYLQQACLWDAALNCAYNLRVHVFDRVLQRDLGFFEGGKGISPGDVAYRITAEAEDVADTLHSLLNTIVPSVLQLSAMATQMLIISPQLSLISAFVIPAMALTVGCLGEKLRAISNDANLSTASLAAYLNEVFPSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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