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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003556`

染色体: Chr08 坐标: 38225019-38226186 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003556`
名称	SmilChr08G003556
描述	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38225019 - 38226186 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996668`
GeneID	`130996668`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996668`
原始查询	`LOC130996668`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit-like
产物	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit-like
Arabidopsis	`AT1G19910` (AVA-P2) ATPase, F0/V0 complex, subunit C protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838579] identity=97.3; qcov=0.974; evalue=1.46e-98; confidence=high
Rice	`Os12g0168900` - identity=96.6; qcov=0.974; evalue=1.88e-97; confidence=high
GO	GO:0033179 (proton-transporting V-type ATPase, V0 domain); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00137 (ATP-synt_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996668

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057777950.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057777950.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057777950.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.60000	`XP_057777950.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057777950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38225105`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A1,A15,A23,A24,A7,A8,B10,B112,B113,B114,B12,B120,B135,B18,B25,B28,B32,B38,B39,B61,B67,B74,B85,B9,B97,C11,C17,C22,C25,C27,C3,C41,C46,C55,C60,C66,C69,D11,D2,D6,D7
`Chr8:38225170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B73,B91,B92
`Chr8:38225181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B106,B113,B120,B125,B138,B15,B25,B45,B72,B81,C17,C24,C26,C37
`Chr8:38225189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C38
`Chr8:38225231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D10
`Chr8:38225234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B43,C35,C44
`Chr8:38225245`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B112,B52,C40,C7
`Chr8:38225245`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B112,B52,C40,C7
`Chr8:38225257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C31
`Chr8:38225282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:38225283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B85,C35,C38,C48
`Chr8:38225323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777950.1

153 aa

153

ATP-synt_C

PF00137 ATP-synt_C 17-76 aa PF00137 ATP-synt_C 97-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777950.1`	Pfam	`PF00137`	ATP-synt_C	Domain	17	76	1.1e-30	106.3	ATP synthase subunit C
`XP_057777950.1`	Pfam	`PF00137`	ATP-synt_C	Domain	97	149	1.1e-30	106.3	ATP synthase subunit C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921967.1
TCATTTAATAATTTACAATATTAATAAATTTTTAAAATTGATTTTCAAAGAACACTACGTACAACCTCAAACTTTCTATAACCTCCACTCAAATATTTCTAAAATTTATTATTATAGCCTCAACTAAAAATTTAAGAACATGATAATGGAGAATGAGACGAATACTTTTCTCCCACCGCAGGTCCGCCCTCAGCCTCACCGGCGACTGCCGAAATTCGCTCTTCATTCTCGCCGCCTCCAACAATGGCTGATTTCTTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996668
ATGTCGTCGACCTTCAGCGGCGATGAAACTGCCCCCTTCTTCGGCTTTCTCGGCGCCGCCGCCGCGCTCGTCTTCTCCTGTATGGGCGCGGCTTACGGAACAGCGAAGAGTGCAGTTGGCGTTGCGTCGATGGGGGTGATGTGGCCGGAGCTGGTAATGAAATCGATTGTGCCGGTGGTTATGGCTGGTGTTTTGGGTATATATGGATTGATTATTGCTGTGATTATCAGCACCGGTATTAACCCTAAGGCTAAGTCTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777950.1
MSSTFSGDETAPFFGFLGAAAALVFSCMGAAYGTAKSAVGVASMGVMWPELVMKSIVPVVMAGVLGIYGLIIAVIISTGINPKAKSYYLFDGYAHLSSGLACGLAGLAAGMAIGIVGDAGVRANAQQPKLFVGMILILIFAEALALYGLFSFS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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