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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003563`

染色体: Chr08 坐标: 38313265-38316762 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003563`
名称	SmilChr08G003563
描述	probable nucleolar protein 5-2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38313265 - 38316762 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996675`
GeneID	`130996675`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996675`
原始查询	`LOC130996675`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable nucleolar protein 5-2
产物	probable nucleolar protein 5-2
Arabidopsis	`AT5G27120` (AT5G27120) NOP56-like pre RNA processing ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832770] identity=81.9; qcov=0.813; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0350300` (BIP102) - identity=76.2; qcov=0.934; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030515 (snoRNA binding); GO:0031428 (box C/D methylation guide snoRNP complex); GO:0032040 (small-subunit processome)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01798 (Nop); PF08156 (NOP5NT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996675

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777956.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057777956.1`
3	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.60000	`XP_057777956.1`
4	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.60000	`XP_057777956.1`
5	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057777956.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38313473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr8:38313514`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C73
`Chr8:38313514`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C73
`Chr8:38313517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:38313626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B67,B69
`Chr8:38313673`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A1,A10,A19,A6,A8,B1,B102,B103,B11,B118,B121,B17,B21,B3,B49,B53,B6,B60,B64,B72,B75,B81,B82,B85,B90,B94,C16,C26,C29,C30,C33,C44,C5,C52,C64,C65,C66,C7,C78,C80,C85,C87,D8
`Chr8:38313674`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	42	A1,A10,A19,A6,A8,B1,B102,B103,B11,B118,B121,B17,B21,B3,B49,B53,B6,B60,B64,B72,B75,B81,B82,B85,B90,B94,C16,C26,C29,C30,C33,C5,C52,C64,C65,C66,C7,C78,C80,C85,C87,D8
`Chr8:38313732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B18,B82,C38
`Chr8:38313734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:38313755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B54,C15,C49
`Chr8:38313942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B65,C26
`Chr8:38313979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	67	A11,A15,A2,A20,A5,A6,B100,B101,B103,B106,B107,B119,B12,B121,B127,B130,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B15,B16,B17,B24,B26,B29,B32,B33,B38,B39,B40,B45,B47,B56,B57,B6,B64,B68,B85,B86,B9,B96,C1,C10,C12,C14,C22,C24,C25,C4,C40,C49,C51,C56,C57,C63,C64,C66,C70,C73,C74,C77,C8,D1,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777956.1

545 aa

272

545

NOP5NT

Nop

PF08156 NOP5NT 2-65 aa PF01798 Nop 166-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777956.1`	Pfam	`PF08156`	NOP5NT	Domain	2	65	6.7e-19	68.7	NOP5NT (NUC127) domain
`XP_057777956.1`	Pfam	`PF01798`	Nop	Family	166	394	1.4e-84	283.8	snoRNA binding domain, fibrillarin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921973.1
AGTAAAATGAAATAAACACTGCGCGCAGCACACCTATTTTCCTAAAACCCTTCTAAAATCTTAAGACTGCGGCGGCGGTAGTGTTCGGTGGTGGTCGGAATATGTTGCTTCTATTTGAAACTCCGGCAGGCTTTGCGCTCTTCAAGGTCCTCGATGAAGGGAAACTTTCTAAAGTCGAGGATTTGGGGAAGGAATTTGCCTCGCCTGACTCCGCTAGAAAGGTCGTCAAGCTGAAAGCATTCTCAAAATTTGAGAATACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996675
ATGTTGCTTCTATTTGAAACTCCGGCAGGCTTTGCGCTCTTCAAGGTCCTCGATGAAGGGAAACTTTCTAAAGTCGAGGATTTGGGGAAGGAATTTGCCTCGCCTGACTCCGCTAGAAAGGTCGTCAAGCTGAAAGCATTCTCAAAATTTGAGAATACTGCGGAGGCTTTGTCTGCTGCTACTCTACTGATAGATAGTAAACCCAGCAAAGGTCTCCGGAAATTCCTGCGCAGTCATTGTGATGGTGACATTTTAGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777956.1
MLLLFETPAGFALFKVLDEGKLSKVEDLGKEFASPDSARKVVKLKAFSKFENTAEALSAATLLIDSKPSKGLRKFLRSHCDGDILAVADSKLGNTIKEKLQIECVHNNSVMELMRGVRSQLTELILGLAAQDMAPMSLGLSHSLSRYKLKFSPDKVDTMIIQAISLLDDLDKELNTYAMRVREWYGWHFPELAKIVLDNILYAKSVKLMGYRSNAAKLDFSEILPEEVETELKEAAVISMGTEVSDLDLENIKDLCNQVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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