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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003568`

染色体: Chr08 坐标: 38440260-38444891 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003568`
名称	SmilChr08G003568
描述	uncharacterized SmilChr08G003568
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38440260 - 38444891 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996678`
GeneID	`130996678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996678`
原始查询	`LOC130996678`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0475100; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os10g0475100; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G03990` (AT1G03990) Long-chain fatty alcohol dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839342] identity=22.4; qcov=0.309; evalue=3.48e-13; confidence=weak
Rice	`Os10g0475100` - identity=24.4; qcov=0.471; evalue=5.77e-16; confidence=weak
GO	GO:0016614 (oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00732 (GMC_oxred_N); PF05199 (GMC_oxred_C); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057777960.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057777960.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057777960.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777960.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777960.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38440529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:38440609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C28,C33,C73
`Chr8:38440795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:38440813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C8
`Chr8:38440894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:38440951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:38441385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:38442060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D7
`Chr8:38442472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C14
`Chr8:38442740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr8:38442866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C14
`Chr8:38443094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777960.1

1167 aa

584

1167

GMC_oxred_N

NAD_binding_8

GMC_oxred_C

PF00732 GMC_oxred_N 22-290 aa PF13450 NAD_binding_8 23-52 aa PF05199 GMC_oxred_C 455-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777960.1`	Pfam	`PF00732`	GMC_oxred_N	Domain	22	290	1.9e-14	54.7	GMC oxidoreductase
`XP_057777960.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	23	52	2.2e-05	25.3	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057777960.1`	Pfam	`PF05199`	GMC_oxred_C	Domain	455	524	2.4e-09	38.6	GMC oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921977.1
AACTGGGGAACTGGTATTATGTCAACGTTGACACGTAAGCCATACAATACTATTTAATTTGTGTGCTTTCCACTTTTCTTCCAGTTAATTATTGTCTTACCTTGTCAATATCACACAGAATGTATTGTTTGTTTGGGACACCAAACTAATACTTTTAGTACAATCCTGTCCCATCACGTAATGATGGAAAAATTGAGCTCGAAGAAGTTGTTTGATACCGGGGGTGATGGAGGTTATGATGCAGTTGTCGTTGGATCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996678
ATGATGGAAAAATTGAGCTCGAAGAAGTTGTTTGATACCGGGGGTGATGGAGGTTATGATGCAGTTGTCGTTGGATCTGGTTATGGAGGTTCTGTTGCAGCTTGTCGGATGTCAATGGCCGGTTTTAAGGTGTGTTTGTTGGAGAAAGGGCGTAGGTGGGAATCTTCCGATTTCCCGACCGACAGTTTTAAGATCTTGTCTACTGTCAGGATGGAAAATAGGAACTTGGGAGTAGATTTTGGCCCAAAAGATGCTCTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777960.1
MMEKLSSKKLFDTGGDGGYDAVVVGSGYGGSVAACRMSMAGFKVCLLEKGRRWESSDFPTDSFKILSTVRMENRNLGVDFGPKDALFQVHVQGDALAATACGLGGGSLVNAGVMISTPARARRDPRWPKSWETDWDRYEASASEMLRVRSMPVKFHMSKIMEGVMGEEYGEDVDNPIKLSMNLEIEEASGSRRPQEIGNCLACGNCLSGCPYNAKNSTDKTYVVSAVQAGCTIRTQCEVQYVVRNEDDTQRSSRRRWLVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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