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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003567`

染色体: Chr08 坐标: 38437792-38440460 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003567`
名称	SmilChr08G003567
描述	uncharacterized SmilChr08G003567
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38437792 - 38440460 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996679`
GeneID	`130996679`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996679`
原始查询	`LOC130996679`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824423]; symbol=AT3G52570; hit=AT3G52570; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824423]; symbol=AT3G52570; hit=AT3G52570; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G52570` (AT3G52570) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824423] identity=65.1; qcov=0.92; evalue=4.08e-138; confidence=high
Rice	`Os01g0862000` - identity=67.9; qcov=0.401; evalue=9.2e-59; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF00975 (Thioesterase); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996679

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777961.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057777961.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777961.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777961.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777961.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38438028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:38438282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B2,C6
`Chr8:38438352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B2,C6
`Chr8:38438374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:38439256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B2,C6
`Chr8:38439375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr8:38439406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:38439872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:38439921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777961.1

327 aa

164

327

Thioesterase

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

Hydrolase_4

PF00975 Thioesterase 53-170 aa PF00561 Abhydrolase_1 54-142 aa PF12697 Abhydrolase_6 54-316 aa PF12146 Hydrolase_4 67-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777961.1`	Pfam	`PF00975`	Thioesterase	Domain	53	170	2.8e-06	28.4	Thioesterase domain
`XP_057777961.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	54	142	2.6e-13	50.9	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057777961.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	54	316	2.4e-18	68.3	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057777961.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	67	145	1.1e-06	28.9	Serine aminopeptidase, S33

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921978.1
TTTCTCCTTTCATCATCATTCTATTACTTGTGCTTCTCTTCAGATTAGTCATCTTCATGGTTTCATTGTTTGTAGCTTAAGTAGTCTAGTTTGCTGGAGTGATTCATTGTGATAGCTCCTTATTTGTAAATTTTGTTCATGAGTGATGAAATCATTCTGAAAGAAAATGATGAATAAACTTAATAATAATTTTTTTCTCAATATTAGAAGTTTTGAAATATGACCAGTTAGATAAGTTGGCTTTCTATACGACGCTGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996679
ATGTTGAGAGGTCGAAGCGGAACCGTTATCCGCCACAATCTGAACCGGCTCCTACACGGGTCGGCGCCGGTCCGCCACCAAACTGGCCGATCCTTCCAAAACCTGGCATATGAAGAGATCAAATCGTTGCCGGATAAACCCTATGAATTCACGGCCTTCGTGCTACATGGCCTCCTCGGCTCTGGTCGGAACTGGCGTTCCTTCTCTCGGTCCCTCGCTTCCTACCTCTCCCCAGCTGCTTGGAGGATGGTACTGGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777961.1
MLRGRSGTVIRHNLNRLLHGSAPVRHQTGRSFQNLAYEEIKSLPDKPYEFTAFVLHGLLGSGRNWRSFSRSLASYLSPAAWRMVLVDLRNHGKSADIEGLLPPHNLKNAAEDVANLVKAEGWDWPDVVIGHSMGGKIALEFVQSCANGDYGHNASLPKQLWVLDSVPGNLISRNDEGEVEKVLQVLQSLPREIPSRKWLVDHMLKLGFSKSLSEWMGSNLKKSGEQETWAFNLDGAVQMLKSYSETDYWPLLEHPPNGME...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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