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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003571`

染色体: Chr08 坐标: 38452425-38459058 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003571`
名称	SmilChr08G003571
描述	sorting nexin 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38452425 - 38459058 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996681`
GeneID	`130996681`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996681`
原始查询	`LOC130996681`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sorting nexin 1
产物	sorting nexin 1
Arabidopsis	`AT5G06140` (SNX1) sorting nexin 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830501] identity=75.5; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0862300` - identity=69; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0035091 (phosphatidylinositol binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00787 (PX); PF09325 (Vps5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996681

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057777963.1`
2	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057777963.1`
3	Endosome	内体	1.00000	`XP_057777963.1`
4	Endosome membrane	内体膜	1.00000	`XP_057777963.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.80000	`XP_057777963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38452747`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr8:38452747`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr8:38455949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777963.1

403 aa

202

403

Vps5

PF00787 PX 62-139 aa PF09325 Vps5 181-396 aa

XP_057777964.1

402 aa

201

402

Vps5

PF00787 PX 61-138 aa PF09325 Vps5 180-395 aa

XP_057777965.1

401 aa

200

401

Vps5

PF00787 PX 60-137 aa PF09325 Vps5 179-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777963.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	62	139	1.9e-22	80.3	PX domain
`XP_057777963.1`	Pfam	`PF09325`	Vps5	Domain	181	396	2.3e-20	73.9	Vps5 C terminal like
`XP_057777964.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	61	138	1.9e-22	80.3	PX domain
`XP_057777964.1`	Pfam	`PF09325`	Vps5	Domain	180	395	2.3e-20	73.9	Vps5 C terminal like
`XP_057777965.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	60	137	1.9e-22	80.3	PX domain
`XP_057777965.1`	Pfam	`PF09325`	Vps5	Domain	179	394	2.3e-20	73.9	Vps5 C terminal like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921981.1
ATAGGCTTTAACTTAACATTGGGCTGAACAACAGAAATTTGAGTGGGGCCATCAGATAATATCGAAGTCTTCTCGCCAAACGCGCCCCTGCTGGCGTAGCTTAGCATAGCAGTCTCCACTTTCGACGTCCACACCCGTTTTCAGTCGCCGCCGACAAATAAGCTGCTCTCACGCGGCGTAGCTTAGCGTCAAGCTGGTTTCAATCTGGAACACGAAGATGATAAGCACGCAGGAAAGTGGATCAGGGCCGTTGGTGCAAA...

XM_057921982.1
TTAACATTGGGCTGAACAACAGAAATTTGAGTGGGGCCATCAGATAATATCGAAGTCTTCTCGCCAAACGCGCCCCTGCTGGCGTAGCTTAGCATAGCAGTCTCCACTTTCGACGTCCACACCCGTTTTCAGTCGCCGCCGACAAATAAGCTGCTCTCACGCGGCGTAGCTTAGCGTCAAGCTGGTTTCAATCTGGAACACGAAGATGATAAGCACGGAAAGTGGATCAGGGCCGTTGGTGCAAAGCCCTCGATCTCCAC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130996681
ATGATAAGCACGGAAAGTGGATCAGGGCCGTTGGTGCAAAGCCCTCGATCTCCACCGTCACAATCGCCGTATATAACCGTATCCGTGCTTGATCCAGCTAAGATGGGAAATGGAGTTCAGGCTTACATCTCCTACAAAGTTATCACCAGGACTAACTTCCCTGAATATGATGGCCCTGAAAAAATTGTTATCCGACGGTACAGTGATTTTGTTTGGCTAAGAGACCGCCTTTTTGAGAAGTACAAGGGTGTCTTTATCCC...

LOC130996681
ATGATAAGCACGCAGGAAAGTGGATCAGGGCCGTTGGTGCAAAGCCCTCGATCTCCACCGTCACAATCGCCGTATATAACCGTATCCGTGCTTGATCCAGCTAAGATGGGAAATGGAGTTCAGGCTTACATCTCCTACAAAGTTATCACCAGGACTAACTTCCCTGAATATGATGGCCCTGAAAAAATTGTTATCCGACGGTACAGTGATTTTGTTTGGCTAAGAGACCGCCTTTTTGAGAAGTACAAGGGTGTCTTTAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057777963.1
MNVAQQESGSGPLVQSPRSPPSQSPYITVSVLDPAKMGNGVQAYISYKVITRTNFPEYDGPEKIVIRRYSDFVWLRDRLFEKYKGVFIPPVPEKSTVEKFRFSAEFIEMRRKALDVFVNRVASHQELQHSEDLRIFLTVDEQTMERARSQETGIFKKKPSDLMQIFKDVQSRVSDVVLGKEKPVEESSPEYEKLKNYVFQLEDHLAEAQKHAYRLVKRHRELGQSLSDFGKAVKLLGECEGNALGKAFSELGAKSEILSI...

XP_057777964.1
MISTQESGSGPLVQSPRSPPSQSPYITVSVLDPAKMGNGVQAYISYKVITRTNFPEYDGPEKIVIRRYSDFVWLRDRLFEKYKGVFIPPVPEKSTVEKFRFSAEFIEMRRKALDVFVNRVASHQELQHSEDLRIFLTVDEQTMERARSQETGIFKKKPSDLMQIFKDVQSRVSDVVLGKEKPVEESSPEYEKLKNYVFQLEDHLAEAQKHAYRLVKRHRELGQSLSDFGKAVKLLGECEGNALGKAFSELGAKSEILSIH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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