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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003591`

染色体: Chr08 坐标: 38728049-38729105 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003591`
名称	SmilChr08G003591
描述	casparian strip membrane protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38728049 - 38729105 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996694`
GeneID	`130996694`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996694`
原始查询	`LOC130996694`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	casparian strip membrane protein 1-like
产物	casparian strip membrane protein 1-like
Arabidopsis	`AT2G27370` (CASP3) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817280] identity=56.2; qcov=1.01; evalue=4.01e-66; confidence=high
Rice	`Os06g0231050` - identity=53.4; qcov=0.813; evalue=1.41e-54; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996694

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777974.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777974.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777974.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777974.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777974.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38728760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B68,C85
`Chr8:38728883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:38728896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr8:38728902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B104,B98
`Chr8:38728923`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A11,A15,A18,A3,B121,B125,C21,C36,C39,C48,C53,C67,C82,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777974.1

198 aa

198

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 35-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777974.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	35	183	1.4e-45	155.5	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921991.1
GGCTATTCAAACTTGCCATTCTCATATCAAAACCAATCAACAGTTAAACAGCAAAGCAAAATCGAGAGATGGAGAAAGGTGAGGCGAAGGCGATCAATATCGCCGAAATAAGCAGAGAAATGGAAGGAAAATCAGCCCTTCTAGCAGGTGCGGGAGCCTCCGCTTTCAAGAGGAGCGTCGCGATTTTCGACCTGATCCTCCGCATAAGCGCCGCCGTGGCTGCTTTGGCCGCCACCATCACCATGGGAACCACCGAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996694
ATGGAGAAAGGTGAGGCGAAGGCGATCAATATCGCCGAAATAAGCAGAGAAATGGAAGGAAAATCAGCCCTTCTAGCAGGTGCGGGAGCCTCCGCTTTCAAGAGGAGCGTCGCGATTTTCGACCTGATCCTCCGCATAAGCGCCGCCGTGGCTGCTTTGGCCGCCACCATCACCATGGGAACCACCGAGCAAACTCTGCCCTTCTTCACACAGTTCTTCCAGTTCACAGCCAGCTACGAAGATCTCCCCGCATTCACATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777974.1
MEKGEAKAINIAEISREMEGKSALLAGAGASAFKRSVAIFDLILRISAAVAALAATITMGTTEQTLPFFTQFFQFTASYEDLPAFTFFVIALSISTGYLVLSVPFSVVCVVQPLHTGPRLLLIFCDTLTLILATSAAASSAAIVYLAHNGNSDANWLPLCQQFGDFCQRISGAVVAGFIAVALLLIMMVLSALALRNH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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