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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003597`

染色体: Chr08 坐标: 38987802-38989545 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003597`
名称	SmilChr08G003597
描述	30S ribosomal protein S16-2, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38987802 - 38989545 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996702`
GeneID	`130996702`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996702`
原始查询	`LOC130996702`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S16-2, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	30S ribosomal protein S16-2%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G56940` (AT5G56940) Ribosomal protein S16 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835796] identity=72; qcov=1; evalue=1.31e-69; confidence=high
Rice	`Os09g0498100` - identity=87.2; qcov=0.826; evalue=7.67e-69; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0015935 (small ribosomal subunit); GO:0032543 (mitochondrial translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00886 (Ribosomal_S16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996702

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057777989.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057777989.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777989.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777989.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777989.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38988132`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	56	A11,A18,A21,A22,A23,A3,A6,A9,B104,B109,B110,B118,B119,B125,B129,B132,B133,B134,B19,B22,B27,B34,B40,B48,B6,B60,B64,B68,B7,B71,B75,B78,B79,B85,B93,B99,C11,C14,C18,C23,C25,C29,C31,C33,C57,C60,C62,C63,C69,C71,C73,C80,C83,D1,D11,D2
`Chr8:38989417`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B136,C28
`Chr8:38989417`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B136,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777989.1

132 aa

132

Ribosomal_S16

PF00886 Ribosomal_S16 9-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777989.1`	Pfam	`PF00886`	Ribosomal_S16	Family	9	70	4.8e-27	94.4	Ribosomal protein S16

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922006.1
TGAAAGTCAGTTAGTCGGTAGAGTTACGGCGTCGTTTACAATTTCGTTAATTAGATTTCTTGTACAGAAAAGATAAAACCCTTCCCAAAACCCTCCTTTGACCCTCTGAAATCCACGAGAGAGAGAGATGGTTGTACGATTGAGGCTATCGAGATTTGGATGTCGGAACAAGCCATTCTACAGATTGATGGCTGCAGATAGCCGATCTCCGAGAGACGGCAAGCATTTGGAAGTCTTGGGCTACTATAACCCCCTTCCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996702
ATGGTTGTACGATTGAGGCTATCGAGATTTGGATGTCGGAACAAGCCATTCTACAGATTGATGGCTGCAGATAGCCGATCTCCGAGAGACGGCAAGCATTTGGAAGTCTTGGGCTACTATAACCCCCTTCCTGGTCAGGATGGCGGTAAAAGAATGGGAGTTAATTTTGACAGAGTGAAGTATTGGCTTTCAGTTGGTGCACAACCCTCTGATCCTGTTCAGCGCCTTCTCTTTCGAGCAGGCTTGTTACCCCCACCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777989.1
MVVRLRLSRFGCRNKPFYRLMAADSRSPRDGKHLEVLGYYNPLPGQDGGKRMGVNFDRVKYWLSVGAQPSDPVQRLLFRAGLLPPPPMLAMGRKGGPRDMRPVDPLSGRVMTEGKQDTVVKEKADVDENLSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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