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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003600`

染色体: Chr08 坐标: 39046229-39053024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003600`
名称	SmilChr08G003600
描述	uncharacterized SmilChr08G003600
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39046229 - 39053024 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996705`
GeneID	`130996705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996705`
原始查询	`LOC130996705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	embryo defective 2735 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830511]; symbol=emb2735; hit=AT5G06240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	embryo defective 2735 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830511]; symbol=emb2735; hit=AT5G06240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G06240` (emb2735) embryo defective 2735 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830511] identity=69.5; qcov=0.932; evalue=2.53e-73; confidence=high
Rice	`Os05g0112750` - identity=59.8; qcov=0.981; evalue=1.04e-61; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057777993.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057777993.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777993.1`
4	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057777993.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39050703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B95,C23,C31,D9
`Chr8:39050790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B8,C51,C57
`Chr8:39050791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:39051075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C31
`Chr8:39051152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:39051157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:39051736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:39051751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:39051753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B23,C31,C72,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092746.1
CCCAATTAATACCCATTGCTCACTCGGCGGGTTGTGTTTTGGATAATGAATTACCAAACCCAGAAGCTGGATTTGAATGTGTTCTTCCGCCGTCTTCGACAGAGAACTTTGATACACCCATTCTACCGCCGCCGAGCGCCACCATCGTCGATGCTCGCAGCTTCTGCCGCCGCTGAATCTACCTGCTTCTTCAGTTTTTTGTTTAATCACTTTTTGTAAAGCTAGCCAGAATGAAGCTGAGAGTGGTCTCTAGGAAGATT...

XR_009092744.1
TCTTGGACTCTTCATTTTCAAAATAGGCCCATCCCAAACCCTTCTCTCATTTTTGTTCACTCAAGCCCACAAACCGCTCACTGCTCTCTCTCGGACTGTCATTCAGCAATTGTCGCCGCCGCTGACGTGCACACCATCATCTCCCTAGCCTCACGCCCTCTGTCTTGCTTTACGAATTTTCCGGCGATAGACGTTAAAGAATTTTCCGGCGATATCCGCCATTTAACGTCGTGCTCCACTGCTCTGTTGCTGCAACAGCA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130996705
ATGAAGCTGAGAGTGGTCTCTAGGAAGATTTATGATTATGTTCGCCACGATCTCAAGGAGATAGCATTTCCATCGTCGTTGCCTGATCCGCCACACATCAAAAAGTTCCGGAAACTTACTTGGAAGGAGCGATACCTTGTGTTGAAGGAAGCATCTAGACTGTATGCTGCAAGCTGGGTTAGGGATATAGGCCCAGAACTCAGGCCAAATGAATACAAAAGGAAAGCAGAGAATGAAGATAACACCAATGGGGAAAAAGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057777993.1
MKLRVVSRKIYDYVRHDLKEIAFPSSLPDPPHIKKFRKLTWKERYLVLKEASRLYAASWVRDIGPELRPNEYKRKAENEDNTNGEKGTSKEKEPSTLEDLAVAARGGMETLRAALQRVYMTRASAYRDALKSFIEGYQEGIQQVMEKKEDSKNQQGPDPPKG

XP_057777994.1
MKLRVVSRKIYDYVRHDLKEIAFPSSLPDPPHIKKFRKLTWKERYLVLKEASRLYAASWVRDIGPELRPNEYKRKAENEDNTNGEKGTSKEKEPSTLEDLAVAARGGMETLRAALQRVYMTRASAYRDALKSFIEGYQEGIQQVMEKKEDSKNQQGPDPPKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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