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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003746`

染色体: Chr01 坐标: 55786538-55788812 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003746`
名称	SmilChr01G003746
描述	uncharacterized SmilChr01G003746
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	55786538 - 55788812 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996708`
GeneID	`130996708`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996708`
原始查询	`LOC130996708`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G33406` (AT5G33406) hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333] identity=26.3; qcov=0.963; evalue=1.26e-18; confidence=low
Rice	`Os06g0658400` - identity=57.4; qcov=1; evalue=2.56e-101; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996708

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778003.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778003.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778003.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778003.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778003.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:55786580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:55786581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:55786582`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B130
`Chr1:55786582`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B130
`Chr1:55786595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B102,B41,C10,C74
`Chr1:55786598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	D11,D4,D9
`Chr1:55786608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B54,C35
`Chr1:55786643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B112,B67,C59,C81
`Chr1:55786663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A15,A23,A3,A9,B119,B122,B129,B28,B44,B81,B86,B95,B99,C29,C4,C47,C57,C76,C84
`Chr1:55786664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A10,A13,A15,A16,B1,B100,B124,B13,B136,B137,B139,B20,B46,B77,B78,B89,B98,C14,C26,C31,C34,C4,C42,C49,C58,C60,C82,D11,D4,D7,D9
`Chr1:55786672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:55786721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B97,C3,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092750.1
GGTATTGCTCTAATCTCTTTTATTTGGCTTGGGCAGTGGGTATGTATGAAGATTGGCTTAAATTGGCTTTGGGTTTTGTTGGATTGAAGTTTAATTTCGAATTGGCAGTGGGTTTATTTGAATTGAAGTTTGGGCAGTTGGTTTATTGAGTTGGGCAGTGGGTTTATTGAATTGGCAGTGGGTATTTCTTAGTATTTTGTTGAATTGGGCAGTGGGTTTATTGAATTGGGCAGTTGATTTATTTGAATTGAAGTTTGATT...

XM_057922020.1
TGTGTGGACACCATGTGTTGTGCATACGCTCAACTTGGCACTTCAGAACATATGCGCCGCAAAGAACGTTTAAAACAATCAAGAGACATATGGATTGTGTTCTTGGATATCTGATGTTTCTTCAGATGCTAACATGATCAAGAACTTCATCATGAATCATGGAATGCGCTTGGTAATGTTCAACAAATTTGTTCCTTTGAAGTTGCTTTCGATTGCTGCAACTCGATTTGCTTCAGTTATTGTGATGTTGAAGCGTCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996708
ATGATCAAGAACTTCATCATGAATCATGGAATGCGCTTGGTAATGTTCAACAAATTTGTTCCTTTGAAGTTGCTTTCGATTGCTGCAACTCGATTTGCTTCAGTTATTGTGATGTTGAAGCGTCTCAAGCTTATCAAGAGATGTTTACTTGAGTTGGTAATTAGTGAGCAATGGGAAGCATATCGAGAGGATGATGTTGAGAAGGCGAGCAATGTTAAAATGAAAGTATTAGATGACACTTGGTGGGATAAGGTTGACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778003.1
MIKNFIMNHGMRLVMFNKFVPLKLLSIAATRFASVIVMLKRLKLIKRCLLELVISEQWEAYREDDVEKASNVKMKVLDDTWWDKVDYILSFTAPLYEMLRACDTDKPCLHLVYDMWDTMIEKVKQAIYKHERLQPEQTSNFYDVVHTILVSRWNKNNTPLHCLAHSLNPRYYSHEWLSEDSSRVAPHRDPEVAKERINCLKKYFPLMSERRVVAQEFANFSSMAGDFSDSDSIAQCYDMDLKSWWVTYGTSAPALQCLAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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