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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003604`

染色体: Chr08 坐标: 39113326-39119802 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003604`
名称	SmilChr08G003604
描述	uncharacterized SmilChr08G003604
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39113326 - 39119802 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996709`
GeneID	`130996709`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996709`
原始查询	`LOC130996709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816963]; symbol=AT2G24280; hit=AT2G24280; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816963]; symbol=AT2G24280; hit=AT2G24280; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G24280` (AT2G24280) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816963] identity=53.3; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0647400` (OsProCP2) - identity=52.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008239 (dipeptidyl-peptidase activity); GO:0070008 (serine-type exopeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05577 (Peptidase_S28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057777999.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057777999.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057777999.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777999.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39113521`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B63,B8,C51,C57
`Chr8:39113521`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B63,B8,C51,C57
`Chr8:39113765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:39113893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr8:39114045`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A22,B23,C16
`Chr8:39114045`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A22,B23,C16
`Chr8:39114088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr8:39116954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B139,B36,B88,C75
`Chr8:39118225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:39118967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:39119248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B139,B36,B4,C75
`Chr8:39119401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777999.1

504 aa

252

504

Peptidase_S28

PF05577 Peptidase_S28 54-482 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777999.1`	Pfam	`PF05577`	Peptidase_S28	Domain	54	482	5.5e-82	276.6	Serine carboxypeptidase S28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922016.1
AAGTCATTCCAAATTATATAGATGATACTACTATACATTACTTAACATTAAAATTCAATTAAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAATCCGCTACAGTACAAGCTGTCCACATTTCAACTTTTATTTTTAAAGAAATGGTTAGCGCATCATCCAATCAGCCACCAGCAAATATATCCAACTTTGTCTAAAATCCCAATTTCCCAACCTCTGCCATGACTGGCTGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTCTGAGTCTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996709
ATGGCGATATGGGTGCTTCTGCTCTCATTTGCAACATTGACGGAATTGTCCGCGAACGCGGCGGCGACGCCTGGTTTTCCATCTTCAGCAATCAAGGCAGAGGCGCAGCGGTCTGTAGCATCCAAAGGCAACAAACTCTACAAAGAAGAGTTCTTCACCCAAATCCTCGATCACTTCAACTACAATCCACAGAGCTACCACACCTTCCAGCAACGCTATCTGATCAACAGCAAACACTGGGGCGGCGCCGCCGCCAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777999.1
MAIWVLLLSFATLTELSANAAATPGFPSSAIKAEAQRSVASKGNKLYKEEFFTQILDHFNYNPQSYHTFQQRYLINSKHWGGAAANSPIFVYTGNEGDIEWFAQNTGFMFETAPHFKALLLFIEHRFYGKSIPYGGSKEVAYSNSSTLGCLSSTQALADYATLILDLKHNLSALDSPVVVFGGSYGGMLAAWFRLKYPHVAVGALASSAPILNFDNITSPFAFNHIITQDFRSESENCYKVIKRSWQEIEDTAAKAGGLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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