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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003643`

染色体: Chr08 坐标: 39864496-39865840 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003643`
名称	SmilChr08G003643
描述	transcription repressor OFP15-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	39864496 - 39865840 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996739`
GeneID	`130996739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996739`
原始查询	`LOC130996739`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor OFP15-like
产物	transcription repressor OFP15-like
Arabidopsis	`AT5G04820` (OFP13) ovate family protein 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830361] identity=39.7; qcov=0.908; evalue=4.35e-34; confidence=medium
Rice	`Os01g0863800` (OsOFP5) - identity=40.4; qcov=0.816; evalue=1.36e-30; confidence=medium
GO	GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04844 (Ovate)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778012.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778012.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057778012.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778012.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:39864929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:39865054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C40
`Chr8:39865074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B37,C40
`Chr8:39865083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:39865089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,D5
`Chr8:39865102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B101,B106,C40,D5
`Chr8:39865102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B106,C40,D5
`Chr8:39865107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:39865173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B128
`Chr8:39865192`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D5
`Chr8:39865192`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D5
`Chr8:39865193`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778012.1

261 aa

130

261

Ovate

PF04844 Ovate 139-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778012.1`	Pfam	`PF04844`	Ovate	Family	139	195	5.8e-24	84.6	Transcriptional repressor, ovate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922029.1
TTTAATATAGTTATCATCACACTGTATTCATAATCTCTCGAATATTGTCTCTATCGATACATGAAGATGACGTACTAGTAAAATATACAGCAGAAACAAAAATTATTTAAAAATTATAGACCCCACTTAAGCTTCTCTCGCCAGTCACTACACCTTAAAATATTCCATTGATTCAATTCAACTTAACTTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTATGCTTTTAATGCTCTCCAAAATTCATACCAACAAAATCAAACCAAACTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996739
ATGGGCAAGAAAAAGAAATTCCCCTTTCTGTTCAAAGCCACCGATTCCCCCACCACCTCCGCCGCCTCTCCGTGGCCGTGGCCGGCCTGCGTCAACAGCCCTAAGACTCTCTCCTTCCGCGCCAACGCCAATTCAAACATCTACAAAACCATCAACTCCGCCTATCTCGACGACGAAAAGGCCACCGCCGAATTCACCGAAACCCCCGACTCCTTCTTCAGCATCCGCCGCGACGAGAGCTTCTCCTCCGCGGCGGCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778012.1
MGKKKKFPFLFKATDSPTTSAASPWPWPACVNSPKTLSFRANANSNIYKTINSAYLDDEKATAEFTETPDSFFSIRRDESFSSAAASQVFPDETAVIGGLRSDRLFFEPGETNSILEEAAKARAFPYSGGGVKIMAMDSDDPFLDFRSSMAEMVVAHGIKRWECLEELLTCYLRVNEKGNHGYIVGAFVDLLIHLSLQAAPLIDSASAADEHCSSSTSTTTHYSFTSPLSFSSSSTYSSTSPGLSMLENEDEIAGEKIPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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