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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003839`

染色体: Chr08 坐标: 44727504-44730225 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003839`
名称	SmilChr08G003839
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 7-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	44727504 - 44730225 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996766`
GeneID	`130996766`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996766`
原始查询	`LOC130996766`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 7-like
产物	rop guanine nucleotide exchange factor 7-like
Arabidopsis	`AT5G02010` (ROPGEF7) RHO guanyl-nucleotide exchange factor 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831858] identity=58.9; qcov=0.837; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0849100` (OsRacGEF1) - identity=59.5; qcov=0.804; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF03759 (PRONE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996766

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057778046.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778046.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057778046.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778046.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:44727743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A19
`Chr8:44727743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:44727759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:44727975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:44728025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B98,C50,C7
`Chr8:44728403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr8:44728408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B22
`Chr8:44728423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:44728441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B74,C11,C69
`Chr8:44728467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr8:44728746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:44728793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778046.1

596 aa

298

596

PRONE

PF03759 PRONE 141-505 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778046.1`	Pfam	`PF03759`	PRONE	Family	141	505	2.7e-177	589.8	PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922063.1
TGATTGTGTGAGAGCCCTTGTTGAAGCAAAGGGTAACAAGCGGCTTGTGTAAGCAAAAAGGAGGAGCCTCGCTGCCTCTTCTTGGTCTCCTCAAGAGCGCCTTCGCTTATCATTCTCTTCTCCATAAAAACCACTCCAATTAATCATCTTTCTCTCTCTCTTTCTAGACATCATTCTTCCACCTCAGTGCTTCAGCAACTATCTTGGAACAATTATTGCCACTTCCCACTCCACCTTTTTTCTTGTTTTATAAACTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996766
ATGGATAGAGCTCTGTCAGACCAAGATACGAAATTGAAGCAGCCCTCTTCCACATTGGCGTTTTGGGTGTCCAAATCCGTCAAATTCTTGAAAAGCAGAGCGAGAAGTTCCAGCACAAGGTACCATTTTGATGGAATGGTAGTGAACAACTCTGTCTACTGTGATTCGCCCAATTACATCGAGGAGAAGATGTTGAATGAAAATGAGAAACATACGTGTAGTAAAATCGGAGAGTTGAAGGATTTGAATGAAGAAGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778046.1
MDRALSDQDTKLKQPSSTLAFWVSKSVKFLKSRARSSSTRYHFDGMVVNNSVYCDSPNYIEEKMLNENEKHTCSKIGELKDLNEEESGESSSSSDFLASEANPCDENSSSEDSSSPPLNCEEVERPHLDKRKLVKQGSCVSETEMMKERFAKLLLGEDMSGCGNGVCTALAISNAITNLCATLFGQIWRLEPLQVEKKLMWRREMDWIVCVSDHIVEFVPSWQTFPDGTKLEVMTSRPRVDLYVNLPALRKLDNMLLEIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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