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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003879`

染色体: Chr08 坐标: 45986506-45989944 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003879`
名称	SmilChr08G003879
描述	uncharacterized SmilChr08G003879
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	45986506 - 45989944 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996812`
GeneID	`130996812`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996812`
原始查询	`LOC130996812`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plastid transcriptionally active 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820077]; symbol=PTAC13; hit=AT3G09210; species=arabidopsis; confidence=high
产物	plastid transcriptionally active 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820077]; symbol=PTAC13; hit=AT3G09210; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G09210` (PTAC13) plastid transcriptionally active 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820077] identity=55.9; qcov=1; evalue=2.68e-122; confidence=high
Rice	`Os03g0825500` (OJ1111_B11.18) - identity=43.5; qcov=0.933; evalue=7.37e-80; confidence=medium
GO	GO:0006354 (DNA-templated transcription elongation); GO:0140673 (transcription elongation-coupled chromatin remodeling)
KEGG	-
Pfam	PF02357 (NusG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996812

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778076.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057778076.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778076.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778076.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778076.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:45987004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr8:45987966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70
`Chr8:45987987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B8,C39,C52
`Chr8:45989393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:45989406`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr8:45989406`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D6
`Chr8:45989452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B82,C48,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778076.1

331 aa

166

331

NusG

PF02357 NusG 96-206 aa

XP_057778077.1

330 aa

165

330

NusG

PF02357 NusG 96-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778076.1`	Pfam	`PF02357`	NusG	Domain	96	206	7.9e-09	36.7	Transcription termination factor nusG
`XP_057778077.1`	Pfam	`PF02357`	NusG	Domain	96	206	8.9e-09	36.5	Transcription termination factor nusG

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922094.1
ATACGGACACATTCGGCATCATGATTGAAAACAGATTTAACCAACCCAATTCCGAGCTGGGCCGAGACCCAACAGCATTATCCACAACCAAAAATCTCAATTCGTCAAAAAACATCAAGCATCATCGTCAGCTGCAAAACGTCGACGGAGAAGATGAAGCTAGGACTTCTGTCATGGAGTCACGCGACATTCCTCTCACTCCCTTTCCCGCCAATCCCCAAACCCAAATATCCAACAATCACCGTGACGCTCAATTCAGT...

XM_057922093.1
CATTCGGCATCATGATTGAAAACAGATTTAACCAACCCAATTCCGAGCTGGGCCGAGACCCAACAGCATTATCCACAACCAAAAATCTCAATTCGTCAAAAAACATCAAGCATCATCGTCAGCTGCAAAACGTCGACGGAGAAGATGAAGCTAGGACTTCTGTCATGGAGTCACGCGACATTCCTCTCACTCCCTTTCCCGCCAATCCCCAAACCCAAATATCCAACAATCACCGTGACGCTCAATTCAGTGGACGAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996812
ATGAAGCTAGGACTTCTGTCATGGAGTCACGCGACATTCCTCTCACTCCCTTTCCCGCCAATCCCCAAACCCAAATATCCAACAATCACCGTGACGCTCAATTCAGTGGACGAAAGCCCGGCTACGGGTAGAGAGAGACGGCAGATGAGGAAGGAGAGAAGAGAGGGGAAGCCCGCCTACAACTGGAAGGAGGAGGTCGAGATGAAGCTCATCAAGAAGCCCAAGAAGCGGTACGTGTCTTGGATGGATGAGCTGAATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778076.1
MKLGLLSWSHATFLSLPFPPIPKPKYPTITVTLNSVDESPATGRERRQMRKERREGKPAYNWKEEVEMKLIKKPKKRYVSWMDELNLDNLALLGPQWWVVRVSRVSGHETAERVARLMARTFPNIEFKVYSPSVQIKRKLKNGTLSVKPKPIFPGCMFLKCVMNKEVHDFIRECEGVGGFIGSKVGNTKRQINKPRPVDEDDMEAIFKQAKEEQGKADQAFEEEQLKAEASNPEKPGVESPLVSQNITQTNTSKKTGGRG...

XP_057778077.1
MKLGLLSWSHATFLSLPFPPIPKPKYPTITVTLNSVDESPATGRERRQMRKERREGKPAYNWKEEVEMKLIKKPKKRYVSWMDELNLDNLALLGPQWWVVRVSRVSGHETAERVARLMARTFPNIEFKVYSPSVQIKRKLKNGTLSVKPKPIFPGCMFLKCVMNKEVHDFIRECEGVGGFIGSKVGNTKRQINKPRPVDEDDMEAIFKQAKEEQGKADQAFEEEQLKAEASNPEKPGVESPLVSQNITQTNTSKKTGGRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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