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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003890`

染色体: Chr08 坐标: 46244232-46248157 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003890`
名称	SmilChr08G003890
描述	O-fucosyltransferase 19-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	46244232 - 46248157 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996818`
GeneID	`130996818`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996818`
原始查询	`LOC130996818`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	O-fucosyltransferase 19-like
产物	O-fucosyltransferase 19-like
Arabidopsis	`AT3G54100` (AT3G54100) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824577] identity=60.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0451900` (OsSTA151) - identity=68.8; qcov=0.641; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996818

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057778080.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778080.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778080.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778080.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778080.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:46244568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70
`Chr8:46244796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D3
`Chr8:46244796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:46244942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:46246166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B8,C39,C52
`Chr8:46246864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B105,B109,B51,C35
`Chr8:46247088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B105,B109,B51,C35
`Chr8:46247173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr8:46247274`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr8:46247274`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr8:46247295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B105,B109,B51,C35
`Chr8:46247313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778080.1

651 aa

326

651

O-FucT

PF10250 O-FucT 242-557 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778080.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	242	557	6.8e-109	365.4	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922097.1
TCTCAGTTCTTCCAATGTAAGTGAAAAAAATATAAAAATAGTACAAAACATAAGCGAAACAAAACATTATTTTTATTTTTGGGTTCACACAGTAGAATGAACATATAAATACTTATACTATAAGAAAACAAAGCAACGGTTCTGCGTTCATGGCCACTGCCCTCCCCTACTTTCTCTCTCTAATCCAATAACTCAATTTTCCATTCCTTTTCTCCGAATTTTGTTCACTAGATTTCATCCTATGTGTATCTTCCGAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996818
ATGTGTATCTTCCGAGCAATGTCAAGCGGCGGAGCCACCACCAATCCACCCACCGCCACCACCCCCACCGTCACCCACCACCGCCGCCGCGTCGCCGACACCGATCAGGAGAAGGAGAAGCCCGCCGCCGATCCGGCGCCAACCTCCGCCGCTTCGGATCGCTCGAAGAGAGACGCGGACGAAGAGGCAATGTTCAGCAACAGCAACGGCAGCGGCAGCGCCCACGGCGGCGGAGGGGGAGGCGGGGGATTGTACCACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778080.1
MCIFRAMSSGGATTNPPTATTPTVTHHRRRVADTDQEKEKPAADPAPTSAASDRSKRDADEEAMFSNSNGSGSAHGGGGGGGGLYHHHHHHHPTIRYLLSRKRVPESWILRGEECVLSACAVFNSLTSRKNMGRTVFVFLLVLMMVSAFMKFSFGGAVSGAGNIIRTEKEILFIHNFKNDLSSNAHMAVFDSEASNGAALQKRQMKEFPVPEIWMKPNSDNYYRCINRPRNWIRTSNKTNGYILVHANGGLNQMRTGICD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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