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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003985`

染色体: Chr08 坐标: 48006329-48007984 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003985`
名称	SmilChr08G003985
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48006329 - 48007984 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996866`
GeneID	`130996866`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996866`
原始查询	`LOC130996866`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT3G50160` (AT3G50160) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824178] identity=26.1; qcov=0.914; evalue=1.22e-27; confidence=low
Rice	`Os12g0481000` - identity=27.2; qcov=0.952; evalue=1.94e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996866

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778118.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778118.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778118.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778118.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778118.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48006832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B91
`Chr8:48007212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:48007463`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr8:48007463`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67
`Chr8:48007521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr8:48007572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:48007579`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B67
`Chr8:48007579`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778118.1

456 aa

228

456

DUF247

PF03140 DUF247 53-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778118.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	53	443	1.2e-73	249.5	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922135.1
GCCAATAATTGTTGGATTAATTATGTGATATATAATTGAACTTGGTCTTCACAATGTAGTAATTTAATACAAACCCAGCCATATTCAACTGCTCCAACATCCAATGCTCTCATACGCTCACAGTGATCACTTCCTTTTTTACCATAAAAAGAATACTCAAAATTCCAAGTGATGCTGCATTCGCAATGGGAAAACACAGCACTACTGCTGAAAACAACAAATTTGAGAGACTTTTCTCCACAGATGAAGCTCTAGCTGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996866
ATGGGAAAACACAGCACTACTGCTGAAAACAACAAATTTGAGAGACTTTTCTCCACAGATGAAGCTCTAGCTGTAGCTGTAACTGTAAGAGATGAATCTAAACAAATGCTACCTCTGGAAAAACGATACGGCGTCGAGCCACCACAGCGCCGCCGGATACACCGAGTGCCGCCGCAGCTACGGCGGAGGAACGAGAATCGAAGAGAGTACGACCCGACGATCGTCTCGCTGGGACCTTACCACCACGGCCAGCCGGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778118.1
MGKHSTTAENNKFERLFSTDEALAVAVTVRDESKQMLPLEKRYGVEPPQRRRIHRVPPQLRRRNENRREYDPTIVSLGPYHHGQPELRAAEEVKHRFLDRLASGSGASKTALHGTILARIGEFRAYYADDECVDKFDDGELATMLLLDACLMVALMEGLAGDSDVFLFWHQCLGIATLQFAFPDLMLLENQLPFPALSLIVNLRRGKEGAGLINSFLNWFLTGDFKPQICSKSDGVEELPLHLLEACHRMLVGSKSPTQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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