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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003950`

染色体: Chr08 坐标: 47279337-47280834 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003950`
名称	SmilChr08G003950
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47279337 - 47280834 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996868`
GeneID	`130996868`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996868`
原始查询	`LOC130996868`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=54.6; qcov=0.247; evalue=2.2e-35; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=48.9; qcov=1.02; evalue=1.09e-154; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996868

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778120.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057778120.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778120.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778120.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778120.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47279436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:47279546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:47279586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B110,B20,B3,B65,B69,B8,B86,C1,C18,C54,C78,D1
`Chr8:47279645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B96
`Chr8:47279652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B26,B44,B57,C79
`Chr8:47279653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr8:47279702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B90,B97
`Chr8:47279724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:47279726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:47279730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:47279753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C1,C40
`Chr8:47279777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778120.1

438 aa

219

438

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 66-104 aa PF04827 Plant_tran 173-376 aa PF13359 DDE_Tnp_4 204-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778120.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	66	104	1.4e-17	63.9	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057778120.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	173	376	2.3e-101	338.4	Plant transposon protein
`XP_057778120.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	204	367	1.1e-09	38.8	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922137.1
TTCTCTCATATCCAATATATATCTTCATAACATCAAAACAAACGACTTATGTCTTCATTTTCTTCTGAAAACAATGTTGAAGAAACAGTTGCATCTGCAGCTGTAGCTGAAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGCACATGCGCCAATACATGGAGGATGATAGTATCCATCAACATGTGCTTCGAGCAATAGCGTCAAACACACCTCACACGAGAAGATATGTGCAAAGAGATCGGGAAGGAGCACACGAGCGACTCATGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996868
ATGTCTTCATTTTCTTCTGAAAACAATGTTGAAGAAACAGTTGCATCTGCAGCTGTAGCTGAAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGCACATGCGCCAATACATGGAGGATGATAGTATCCATCAACATGTGCTTCGAGCAATAGCGTCAAACACACCTCACACGAGAAGATATGTGCAAAGAGATCGGGAAGGAGCACACGAGCGACTCATGCGGGATTATTTTGATGATAATCCAACATTGGGTCCCAATGTATTTCGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778120.1
MSSFSSENNVEETVASAAVAEAEAFMEEHMRQYMEDDSIHQHVLRAIASNTPHTRRYVQRDREGAHERLMRDYFDDNPTLGPNVFRRHFRMRKELFTRIVNALEAHNTWFQQRPDATGKKGFTPLQKCTNAVRQLAYGGPVDHYDEYLRVSETTGYECLRHFCRGVIEVFDGHYLRRPTVDDYQRLMEMHEQRHGFPGMLGSLDCMHWTWKNCPVAWKGQFTRGDHGVPTIMLEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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