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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004001`

染色体: Chr08 坐标: 48328565-48329949 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004001`
名称	SmilChr08G004001
描述	ferritin-like catalase Nec2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48328565 - 48329949 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996872`
GeneID	`130996872`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996872`
原始查询	`LOC130996872`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferritin-like catalase Nec2
产物	ferritin-like catalase Nec2
Arabidopsis	`AT1G47980` (AT1G47980) desiccation-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841216] identity=55.7; qcov=0.91; evalue=9.05e-110; confidence=high
Rice	`Os03g0345300` - identity=56.9; qcov=0.913; evalue=7.91e-112; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13668 (Ferritin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996872

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057778132.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057778132.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057778132.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778132.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48328868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:48328893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A23,B134,B137,B9
`Chr8:48328940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B85,B86,B89,C51
`Chr8:48328952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C39
`Chr8:48328960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C52
`Chr8:48329026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C52
`Chr8:48329030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:48329059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:48329084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:48329106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:48329147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:48329177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778132.1

310 aa

155

310

Ferritin_2

PF13668 Ferritin_2 43-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778132.1`	Pfam	`PF13668`	Ferritin_2	Domain	43	209	2.3e-26	93.3	Ferritin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922149.1
ACACACAAAAAAGAAAAAAGAAAAATGGCGCTTGTATCAACACCTATTGCCGTTGCCATATTGATGCTAATAATGATTGTTCCAAGTAGGAGCTCCGACCCGGTTTGCCCTCCGGGTTACCCGACCCATGAAACCCCAGTGACCCGACGAGACAAGGACTTGTTCAAGTTTTCATTAAACATGGAGTACTTGGAAGCTGAATTTTTCCTCTGGGGCGCCTTCGGCTACGGCCTCGATCGCGCCGCGCCGGCGCTCGTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996872
ATGGCGCTTGTATCAACACCTATTGCCGTTGCCATATTGATGCTAATAATGATTGTTCCAAGTAGGAGCTCCGACCCGGTTTGCCCTCCGGGTTACCCGACCCATGAAACCCCAGTGACCCGACGAGACAAGGACTTGTTCAAGTTTTCATTAAACATGGAGTACTTGGAAGCTGAATTTTTCCTCTGGGGCGCCTTCGGCTACGGCCTCGATCGCGCCGCGCCGGCGCTCGTCAACGGCGGCCCTCCGCCCGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778132.1
MALVSTPIAVAILMLIMIVPSRSSDPVCPPGYPTHETPVTRRDKDLFKFSLNMEYLEAEFFLWGAFGYGLDRAAPALVNGGPPPAAAQKANLDSLTEHMIGEFGLQEIGHIRSIVRTAGGFPRPLMDLSADNFAKLLDGAFGCKMEPPFDPYRDPLSYMIGAYALPYLGLVGYVAANPFLVGDISKALLARLLGVEAGQDAVIREYLYERAAEVVRPYNHTVAEFTARISEVNNRLAKCGVKDEGIIVPRYLGAENRTES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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