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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003977`

染色体: Chr08 坐标: 47846237-47847876 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003977`
名称	SmilChr08G003977
描述	uncharacterized SmilChr08G003977
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	47846237 - 47847876 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996881`
GeneID	`130996881`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996881`
原始查询	`LOC130996881`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=35.8; qcov=1; evalue=1.65e-37; confidence=medium
Rice	`Os03g0643050` - identity=42.5; qcov=0.995; evalue=4.04e-57; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996881

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778143.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057778143.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057778143.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778143.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778143.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:47847087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B51
`Chr8:47847102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B131,B139,B24
`Chr8:47847106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B2
`Chr8:47847111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr8:47847125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A7,B106,B108,B110,B111,B114,B119,B122,B127,B131,B133,B18,B23,B27,B30,B81,B9,C16,C18,C3,C33,C64,C65,C66,C70,D2,D8
`Chr8:47847147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B61
`Chr8:47847153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C65
`Chr8:47847188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B140,C27,C43
`Chr8:47847192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	149	A1,A10,A11,A18,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B102,B107,B108,B11,B110,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B123,B125,B126,B127,B128,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B19,B22,B24,B25,B27,B28,B30,B31,B36,B38,B39,B4,B44,B45,B46,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B60,B61,B62,B65,B7,B70,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B84,B85,B86,B88,B90,B91,B92,B94,B98,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C21,C22,C23,C24,C26,C28,C3,C30,C31,C34,C35,C38,C39,C40,C41,C42,C44,C49,C5,C51,C52,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C67,C69,C7,C72,C73,C74,C75,C77,C80,C82,C86,C87,D1,D3,D7,D9
`Chr8:47847204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:47847207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B118,B46
`Chr8:47847216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778143.1

215 aa

108

215

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

Plant_tran

PF13359 DDE_Tnp_4 7-154 aa PF01609 DDE_Tnp_1 9-153 aa PF04827 Plant_tran 99-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778143.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	7	154	3.3e-23	82.8	DDE superfamily endonuclease
`XP_057778143.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	9	153	2.2e-08	34.8	Transposase DDE domain
`XP_057778143.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	99	156	1.3e-05	25.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922160.1
GTATATCTATTTACTCCCTGCTCGATTTTTTTTGGGGGGGACTTATATGATTCAAACATATCATAATACTTCTCATTTGTGTGCAGCCACGTATTTTGAGTTTGTTGCTTGAGAATCGCAATGCCGACTGATGATATTAATACAATATGCATTTATATGTTGATGGAAGAGATTTTCCTTCAACATTTAATTCTCATACTTGTAGCTTATCATATTATGGTTAGGATGAGATCTCGTAAACGAAAAAGAGGTGCTAATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996881
ATGGTGAGTAATGTTGATAAGCCGAGGTACCGAACTCGAAAAGGCCAGATATCAACAAATCCCCTTGCCGTTTGTGATCGCAATATGAAGTTCGTGTACGTGCTACCTGGCTGGGAAGGGTCAGCCGCAGATTCGAGGATATTGCGTGATGCCCTCCAACGTGTTAATGGATTTAGGGTGCCCAAGGGATATTATTACCTATGCGACAACGGGTACGCTAATAGCGAGGGATTTCTTGCTCCATATAAGGACATACGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778143.1
MVSNVDKPRYRTRKGQISTNPLAVCDRNMKFVYVLPGWEGSAADSRILRDALQRVNGFRVPKGYYYLCDNGYANSEGFLAPYKDIRYHLKEWGPNAARPQNAQELFNLRHSKARNVIERAFGIMKMRWGCLRSNTFYPVKTQIHLIMSCFILNNFIRSEMPIDPIEQEFDSATENDQEEAEFDGEFIDGIDSSPQWNAERDAIAQAMWINYINNI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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