当前解析结果
SmilChr08G003975| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003975 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003975 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003975 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 47755020 - 47756265 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130996888 |
|---|---|
| GeneID | 130996888 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996888 |
| 原始查询 | LOC130996888 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996888 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057778151.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057778151.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057778151.1 |
| 4 | Nucleolus | 核仁 | 0.20000 | XP_057778151.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778151.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:47755720 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr8:47755724 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B99,C87 |
Chr8:47755919 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 63 | A15,A18,A2,A23,A25,A4,A5,B1,B102,B104,B109,B123,B136,B14,B18,B21,B24,B26,B28,B30,B33,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B49,B55,B7,B72,B80,B81,B82,B84,B85,C1,C16,C30,C32,C34,C35,C37,C39,C48,C52,C57,C58,C59,C62,C63,C65,C67,C68,C76,C77,C8,C83,D5,D6,D8 |
Chr8:47756057 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。