当前解析结果
SmilChr08G003962| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003962 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003962 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003962 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 47568797 - 47569634 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996890 |
|---|---|
| GeneID | 130996890 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996890 |
| 原始查询 | LOC130996890 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996890 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057778153.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057778153.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057778153.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778153.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778153.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:47568984 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C22 |
Chr8:47568989 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,C22,C4 |
Chr8:47569021 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 8 | A3,B126,B17,B5,C2,C23,C31,C58 |
Chr8:47569030 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B58,C11,C25 |
Chr8:47569073 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | B105,B128,B38,B58,B99,C11,C25,C28,C42,C83 |
Chr8:47569101 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A21,B32,B35,B62,B73,C22,C31,C39,C4,C41,C62,C75,D10,D11 |
Chr8:47569107 |
GC |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B106,B17,C24 |
Chr8:47569109 |
ATT |
* |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B106,B17,C24 |
Chr8:47569112 |
CCA |
* |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B106,B17,C24 |
Chr8:47569172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr8:47569182 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,B114,C25 |
Chr8:47569187 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,C24 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。