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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004008`

染色体: Chr08 坐标: 48449905-48453101 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004008`
名称	SmilChr08G004008
描述	formin-like protein 11
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48449905 - 48453101 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996909`
GeneID	`130996909`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996909`
原始查询	`LOC130996909`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	formin-like protein 11
产物	formin-like protein 11
Arabidopsis	`AT3G05470` (AT3G05470) Actin-binding FH2 (formin homology 2) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819712] identity=53; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0461800` (dw2(fh2)) - identity=59; qcov=0.521; evalue=8.97e-158; confidence=medium
GO	GO:0030036 (actin cytoskeleton organization); GO:0045010 (actin nucleation); GO:0051015 (actin filament binding)
KEGG	-
Pfam	PF02181 (FH2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996909

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778158.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778158.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778158.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778158.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48450260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B13,B130,C65,C82
`Chr8:48450273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B13,B130,C65,C82
`Chr8:48450310`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr8:48450310`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr8:48450381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:48450392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:48450405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:48450419`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr8:48450419`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr8:48450473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,D7
`Chr8:48450476`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr8:48450476`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778158.1

804 aa

402

804

FH2

PF02181 FH2 399-784 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778158.1`	Pfam	`PF02181`	FH2	Family	399	784	3.2e-100	336.6	Formin Homology 2 Domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922175.1
CGTAGAGAGTAGATAAGAAGAGTAAGAGCAGAGAAGATGAAGAGTAATTAACTTAGCAGTAATACCAAGAAAGAATAGAAGAAGCAGATGAAATAAAGAAGGACCAGTACAACTACAACTGCCAAAGCTCAGGGGTTCCTTGCTTGGAGTAGCATTAAAGTAACATCTTCTTCTCCTCCACTCCCACCCTTCATAAACTAATAACCTCCCATTTCTCCACCAATTTATTACACCATTCATTTTTACACACAAAAAAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996909
ATGGGTCATCATCTTTCCCACATGATTCTCATCATCATTGTTTTCTTCCTCATCTCTTTCCACACTCTGATCTCAATCGATTACACCAATCATGGCGCTCGCAAAAGTTTTGTTAATCACCACTCCAAAAGGGTCTTTTTGTTCGAGAAATTCAGGGTCTTGCTCGGCCTCAAGCCCAGAAACGGAGACCTCTCGCATTTCTCTGCATCGCCGGCGCCGGCGCCGGGGCCCGGCATTGCCCCGGCACCTTCTCCGGCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778158.1
MGHHLSHMILIIIVFFLISFHTLISIDYTNHGARKSFVNHHSKRVFLFEKFRVLLGLKPRNGDLSHFSASPAPAPGPGIAPAPSPAARRRPHTPLRHRHPLPQAHKVRKEEERGRGKRVMTAVLASVGVTSALCAAAMLVGCRKLKKRRRKQRRRGLSKFVSSQSSVKKVTSDPGPDLFYLNSLESALEPDKCCLKLNSAAATICSGENAFDEREVKPADSVGESGRFSSFGEITTVHEISECVDGSSSSCGERIIPEEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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