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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004014`

染色体: Chr08 坐标: 48514582-48517673 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004014`
名称	SmilChr08G004014
描述	autophagy-related protein 18a-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48514582 - 48517673 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996915`
GeneID	`130996915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996915`
原始查询	`LOC130996915`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 18a-like
产物	autophagy-related protein 18a-like
Arabidopsis	`AT3G62770` (AtATG18a) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825452] identity=58.6; qcov=0.981; evalue=3.31e-148; confidence=high
Rice	`Os01g0934000` (OsATG18c) - identity=54.9; qcov=0.952; evalue=1.08e-132; confidence=high
GO	GO:0000422 (autophagy of mitochondrion); GO:0005515 (protein binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006497 (protein lipidation); GO:0019898 (extrinsic component of membrane); GO:0032266 (phosphatidylinositol-3-phosphate binding); GO:0034045 (phagophore assembly site membrane); GO:0034497 (protein localization to phagophore assembly site); GO:0044804 (nucleophagy); GO:0080025 (phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF21032 (PROPPIN); PF21034 (BCAS3_WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996915

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778166.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057778166.1`
3	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.40000	`XP_057778166.1`
4	Autophagosome	Autophagosome	0.40000	`XP_057778166.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48516764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:48516819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:48516892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B7,C62,D6
`Chr8:48516954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C49
`Chr8:48517114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:48517183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70
`Chr8:48517298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B41,B71,B89,C70
`Chr8:48517317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:48517337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:48517390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:48517437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B71,B89,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778166.1

377 aa

188

377

PROPPIN

BCAS3_WD40

WD40

PF21032 PROPPIN 44-375 aa PF21034 BCAS3_WD40 199-280 aa PF00400 WD40 248-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778166.1`	Pfam	`PF21032`	PROPPIN	Repeat	44	375	2.2e-28	100.2	PROPPIN
`XP_057778166.1`	Pfam	`PF21034`	BCAS3_WD40	Repeat	199	280	1.2e-13	51.3	BCAS3, WD40 repeat
`XP_057778166.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	248	278	9.3e-09	36.2	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922183.1
TTTTTTCCTAACAAACAGTCGTTGCTTATGTGTGTATTCGTAATTCATAAAAATCTTAATTCGAAAAGGACTCGAGTCCTGAAACTGAAACTAGTCTTCTTCTCCTTCTCCGTCTCAATCTCAACTCCTTTTTCTCTCTCCAAAATCATATTTCTTCACCCACAATCATGCTACTGCACTCCATACTTATAAAACTTCAATGTCGATGAGCTCCCCACTCTGCGTCTCCTCCTGCTCCTCCCCGTCGTCGTCGGACTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996915
ATGTCGATGAGCTCCCCACTCTGCGTCTCCTCCTGCTCCTCCCCGTCGTCGTCGGACTCCTCTTCCTCCGCCATGCCTCCATCCGTCCCCGTCCAAACCCCCAATCCTGTGAAACCGGCGTCCGTACTCCGCTTCTCCTTCAATCAGGACGCCAGCTGCTACGCTGTTGGCACAACCGACGGCTTCATCGTCTTCAAGGCCGATCCTTTCGCCGAAGCCTTCCGCCGCAACTTCTCCGGCGGCATTGGCATCGTTCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778166.1
MSMSSPLCVSSCSSPSSSDSSSSAMPPSVPVQTPNPVKPASVLRFSFNQDASCYAVGTTDGFIVFKADPFAEAFRRNFSGGIGIVQMLFRCNVLALVGASKSDRNKVMIWDDHLNRCIGELLFRSEVQAVRLRTDRIVVVLLHKVNVYNFSDFKLTHQIETLENPRGLCEISQARSMVLVCLGLQRGCVRVEQYATAKCNHVMAHNSSVAFVALMDDGRLMATASSKGTLVRVFTTMDGSLLKELRRGSERAAIYSLSFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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