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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004095`

染色体: Chr08 坐标: 49628288-49631427 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004095`
名称	SmilChr08G004095
描述	cation/calcium exchanger 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49628288 - 49631427 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996928`
GeneID	`130996928`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996928`
原始查询	`LOC130996928`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cation/calcium exchanger 5-like
产物	cation/calcium exchanger 5-like
Arabidopsis	`AT1G08960` (CAX11) cation exchanger 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837416] identity=65.1; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0180000` (OsCCX1) - identity=29.1; qcov=0.971; evalue=5.69e-55; confidence=low
GO	GO:0006812 (monoatomic cation transport); GO:0008324 (monoatomic cation transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01699 (Na_Ca_ex)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996928

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057778186.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057778186.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057778186.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778186.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778186.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49628518`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C49
`Chr8:49628518`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C49
`Chr8:49628556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:49628606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B55
`Chr8:49628797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B51,C16,C49,C73
`Chr8:49628827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,D8
`Chr8:49629145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:49629190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C12
`Chr8:49631021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:49631037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr8:49631086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr8:49631144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B47,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778186.1

553 aa

276

553

Na_Ca_ex

PF01699 Na_Ca_ex 96-237 aa PF01699 Na_Ca_ex 397-546 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778186.1`	Pfam	`PF01699`	Na_Ca_ex	Family	96	237	5.3e-51	173.3	Sodium/calcium exchanger protein
`XP_057778186.1`	Pfam	`PF01699`	Na_Ca_ex	Family	397	546	5.3e-51	173.3	Sodium/calcium exchanger protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922203.1
GAGGAATTGGAGATCGCAGATCCAAGAGAGAAAAGCGCGTTAAAAGAGACGAACACAACAAAAGAAAAATATACTACTCCTATTATTTAAAAATTGAAGTGTCGTCGAAAGTCAAAAGATTCACTCATCTGATTTCCAGTGAAGCAAAAATACAAACAGAATGAATGCATAAATCAGTGCTGCTACAAAATTTGGAATGGCATGGCCTTCAAATTCGCCGCCGCCGCCGCCACGTGCCGCCGGATTTTCAACTTCACCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996928
ATGGCCTTCAAATTCGCCGCCGCCGCCGCCACGTGCCGCCGGATTTTCAACTTCACCGTGATCCCACTCCTCCTCCTCGCCACCCTCCTCTTCTTCCTCCTCCACCCCCGCGCTACAATTCCCAACTACCCCTCAAAACCCCAACTATTTCCCCGCAGATCCTTGCTCGCGCCGACCCCCAAATGCTCGCCCTCCAACACTACAGCGGCCGACGGCCTATTCAATTACTCATCTCTCCATTCCTGCTTCCTCCGCGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778186.1
MAFKFAAAAATCRRIFNFTVIPLLLLATLLFFLLHPRATIPNYPSKPQLFPRRSLLAPTPKCSPSNTTAADGLFNYSSLHSCFLRGNLFLSVPLLALILLLQFYILVKTAQDRFSVVVTKLAAHLKLSPSMGAVTLLALGNGAPDVFASVAAVRGGQPRTGFGAILSAGTFVSAFVVGFVALYAAPFAVDPAPFIRDVMFYLTAAFFLFYVYLSAEIFLWQAIGFVAFYIFFVGIVFSMDSGYAGVAGEKGRSSRNGGGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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