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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004100`

染色体: Chr08 坐标: 49703588-49705732 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004100`
名称	SmilChr08G004100
描述	probable transcription factor At3g04930
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49703588 - 49705732 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996937`
GeneID	`130996937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996937`
原始查询	`LOC130996937`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transcription factor At3g04930
产物	probable transcription factor At3g04930
Arabidopsis	`AT5G28040` (AT5G28040) DNA-binding storekeeper protein-related transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832874] identity=42.6; qcov=0.949; evalue=3.39e-79; confidence=medium
Rice	`Os07g0636100` - identity=41.4; qcov=0.432; evalue=2.28e-34; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04504 (GeBP-like_DBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778206.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778206.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778206.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778206.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778206.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49704640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B41,B71,B89,C70
`Chr8:49704710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:49704805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:49704824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C30
`Chr8:49704862`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B101,B15,B2,B71,C8
`Chr8:49704862`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B101,B15,B2,B71,C8
`Chr8:49704887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:49704947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B46,B65,C5
`Chr8:49705025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C5
`Chr8:49705042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B25,B44,C1,C54
`Chr8:49705052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B34,C57,C83
`Chr8:49705064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778206.1

391 aa

196

391

GeBP-like_DBD

PF04504 GeBP-like_DBD 94-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778206.1`	Pfam	`PF04504`	GeBP-like_DBD	Domain	94	193	4.3e-31	108.2	Glabrous-enhancer-binding protein-like family, DBD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922223.1
GTAATTGAAATGACAATTAGAATCCTCTTGGGTTGAATTAGAAACCATTAATTGTAATTAAGCCCAAAATGAGGTGAAGAGTAAAGTGGGTTTTTACCAAACAATTAGGAATTAGGAATAGGATTAGCTGTAGAGAGAGTAGCGTAGGTGGCGTGTGGTGAAGCGTTCAAACCCACTTGGTTTGGGTCTCTCCATACCAAACCCACCAATTACACACCATGCCAGCCTCGCCGTGAACCCCCAATTCCCCACCCCCACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996937
ATGGCCTCCGCCGACGAGCCCGCCTCCGCCGCCGCCCCTCTCATCTTCAACGAGGACGAGGACCTCCTCGACGACGACGACGACGACGAGAGCTTCGACCACTACGACGACGATTCCGCCTCCTCCGCCCCCGTCGCCGTCGATCGTCCCCCTCCGCCCGTCTCCGCCGCCCAGGTCACGATCGCCGTCCCCGGCCTCCCCGATCCCCACCACCAGCAGCAAATTCAGCCGGAGATCGCGAAGAAGCCGCCGCCGCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778206.1
MASADEPASAAAPLIFNEDEDLLDDDDDDESFDHYDDDSASSAPVAVDRPPPPVSAAQVTIAVPGLPDPHHQQQIQPEIAKKPPPPPDESRKLFQRLWTDEDEIELLQGFLDYTTQRCGPHSSSQHHHDTTAFYDQIRSKFQLDFNKNQLVEKLRRLKKKYRNVISKFGTGKEYTFKSPHEQATFEISSKIWGNAAVNGAAAYRAPPVPIDEDEDGINNPNFNNFVDCQSPNPNGIDINAKTPRSRKRNRAGAVKLEEKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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