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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004053`

染色体: Chr08 坐标: 49045740-49047037 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004053`
名称	SmilChr08G004053
描述	carboxylesterase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49045740 - 49047037 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996944`
GeneID	`130996944`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996944`
原始查询	`LOC130996944`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	carboxylesterase 1-like
产物	carboxylesterase 1-like
Arabidopsis	`AT5G62180` (CXE20) carboxyesterase 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836339] identity=48.9; qcov=1.01; evalue=1.93e-111; confidence=high
Rice	`Os08g0547800` - identity=46.4; qcov=0.944; evalue=1.92e-85; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07859 (Abhydrolase_3); PF10340 (Say1_Mug180); PF20434 (BD-FAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996944

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778213.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778213.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778213.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778213.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778213.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49045820`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B130,B6,B62
`Chr8:49045820`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B130,B6,B62
`Chr8:49046031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B56
`Chr8:49046058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr8:49046134`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B110,B79,C18,C60
`Chr8:49046134`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B110,B79,C18,C60
`Chr8:49046153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A15,C64,C66
`Chr8:49046153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,C64,C66
`Chr8:49046157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B69,B73,B97,C46
`Chr8:49046163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:49046208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C46
`Chr8:49046258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778213.1

322 aa

161

322

Say1_Mug180

BD-FAE

Abhydrolase_3

PF10340 Say1_Mug180 65-188 aa PF20434 BD-FAE 68-181 aa PF07859 Abhydrolase_3 83-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778213.1`	Pfam	`PF10340`	Say1_Mug180	Family	65	188	7.5e-06	25.8	Steryl acetyl hydrolase
`XP_057778213.1`	Pfam	`PF20434`	BD-FAE	Domain	68	181	1.1e-14	55.2	BD-FAE
`XP_057778213.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	83	300	5.8e-49	167.4	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922230.1
TCATCATAGAAAAAATCAAACTCAATTAAAAATTTATGTATTACTAACATTTGAAAGTAATAAAAAAATAAAAATTCATCCAAAATTGATAAATTTTGACGCTATTTGCCCTAATAAATTACAACGCAAAGTGTCATCTGGAAACTTGACGCGTTGTATTGTATGTATGAATTACTTGGTTGCCTAGTCCAATTTACGAATGCAATTACTTGGTTCCTTCCGAAGCCCAAAGTGACACTAACTGAAAATATATCAATAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996944
ATGTCTTCATCGGATTCCACACAAACCCAATCCATTTCCGACCCCTACGCCAACCTCGGCCTCACCAAAAACTCCGACGGTTCCTTCACACGCACCGCCGAATTCAATCCCACCACCGCCGCCTGCTCCGATCCACCCAGCTCAACTCCCCTCCTCACCAAGGACGTCCCCATCAACCCACACAACAACACCTGGGCCCGAATCTACCTCCCCCGCCGCAAATCCTCCTCCCCCAAACTGCCCCTCCTACTCTTCTTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778213.1
MSSSDSTQTQSISDPYANLGLTKNSDGSFTRTAEFNPTTAACSDPPSSTPLLTKDVPINPHNNTWARIYLPRRKSSSPKLPLLLFFHGGGFVVASAASTFFQSFCSEIALHLPAVMVSVDYRNAPEHRLPAAYDDCTEALLWLKSGDEWLSEHADLSNCYIMGNSAGGNIALRVGMQASRRVDELAPARIRGLILHQPFFGGEERTASEIRLAENKVIPLLMTDVIWELALPVGANRDHEFSNPSMELKLDEVINERWRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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