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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004057`

染色体: Chr08 坐标: 49197000-49200281 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004057`
名称	SmilChr08G004057
描述	uncharacterized SmilChr08G004057
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49197000 - 49200281 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996947`
GeneID	`130996947`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996947`
原始查询	`LOC130996947`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819689]; symbol=AT3G05250; hit=AT3G05250; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819689]; symbol=AT3G05250; hit=AT3G05250; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G05250` (AT3G05250) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819689] identity=45.5; qcov=1.03; evalue=1.01e-83; confidence=high
Rice	`Os03g0809800` (OsRFP) - identity=38.7; qcov=0.636; evalue=6.82e-30; confidence=medium
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996947

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778216.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778216.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778216.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778216.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778216.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49197264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B61,B7,C15,C42,C51
`Chr8:49197315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr8:49198256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:49198257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr8:49199463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B41,B71,B89,C70
`Chr8:49199473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B114,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778216.1

272 aa

136

272

zf-C3HC4

PF00097 zf-C3HC4 25-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778216.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	25	73	1.6e-07	31.8	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922233.1
TTCAGATAATCATATGGCAGAAGAAGAAAGGTTGAGCGGCTCCTCTGCCGGCCCGAGCCCGAGCCCGACCCCGACCCATAATCCGTGCCCCATTTGCCTCTCCCCTACAACGCAAGAATCCTATTTGGATCAGTGTTTCCACAAATTTTGCTATCACTGCATAGTGAAATGGATCAATATAGTTGCACGCCGGCAATCCTGTTCATCTTCATCGATGACTTGTCCTTTGTGCAAGAGAGAGAACTTCTCGATTATCTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996947
ATGGCAGAAGAAGAAAGGTTGAGCGGCTCCTCTGCCGGCCCGAGCCCGAGCCCGACCCCGACCCATAATCCGTGCCCCATTTGCCTCTCCCCTACAACGCAAGAATCCTATTTGGATCAGTGTTTCCACAAATTTTGCTATCACTGCATAGTGAAATGGATCAATATAGTTGCACGCCGGCAATCCTGTTCATCTTCATCGATGACTTGTCCTTTGTGCAAGAGAGAGAACTTCTCGATTATCTGTGGATATGATGGAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778216.1
MAEEERLSGSSAGPSPSPTPTHNPCPICLSPTTQESYLDQCFHKFCYHCIVKWINIVARRQSCSSSSMTCPLCKRENFSIICGYDGTSFQRHYVGKSLGDSEFFSEAHRYRLKCYYTDPGDIAEKVHVSLYWKFRKYLRQNHFLADWLRREIQAVMQEEDVDVIMHHVLGVVDSLRRDWSKKTSVSTEKAREEFRAAVSDAVRPFLTGRTERFVEELEVFVASGLNMDAFDEMYIKHLGWKESEKDCDETHEPTPAVPYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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