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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004035`

染色体: Chr08 坐标: 48812427-48814685 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004035`
名称	SmilChr08G004035
描述	F-box protein At1g55000
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48812427 - 48814685 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996951`
GeneID	`130996951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996951`
原始查询	`LOC130996951`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At1g55000
产物	F-box protein At1g55000
Arabidopsis	`AT1G55000` (AT1G55000) peptidoglycan-binding LysM domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841942] identity=61; qcov=0.838; evalue=2.64e-102; confidence=high
Rice	`Os03g0699600` (OsFbox168) - identity=57.7; qcov=0.782; evalue=9.24e-90; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF01476 (LysM); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778220.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778220.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778220.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778220.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778220.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48812847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:48814237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A15,A16,A20,A25,A6,B105,B121,B123,B125,B14,B28,B3,B31,B35,B37,B38,B43,B44,B47,B52,B7,B71,B78,B8,B87,B92,B93,B94,B99,C18,C2,C23,C30,C32,C43,C44,C56,C58,C61,C67,C68,C72,C73,C87,D2,D8
`Chr8:48814247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B43,B52,C87
`Chr8:48814266`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A25,A6,B108,B125,B14,B3,B35,B38,B44,B78,B94,B99,C18,C2,C43,C61,C73
`Chr8:48814272`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A25,A6,B108,B133,B140,B3,B35,B38,B44,B78,B94,B99,C18,C2,C43,C61
`Chr8:48814407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B128,B17
`Chr8:48814453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C83
`Chr8:48814453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778220.1

266 aa

133

266

F-box

F-box-like

LysM

PF00646 F-box 52-85 aa PF12937 F-box-like 57-86 aa PF01476 LysM 129-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778220.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	52	85	4.8e-07	30.1	F-box domain
`XP_057778220.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	57	86	1.7e-07	31.6	F-box-like
`XP_057778220.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	129	167	0.00031	21.3	LysM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922237.1
GAATAATTCATTTTGTAAAAAATAAACGAAAAAACAAATTAATACCATCACTATTAACAGTTTCAAAAAAAAAATACCATCATTATTAACGAAACCCCCACTAGAAAACTACACGGCACCAAACCAAAGGCGGAGAAACGCACACGAACAAAAGCCTCATCCGCACCAAAAGTAATTTATGGGCTGCTGCGGCGACGACGACGACGACGACGCACCACCACAACCGTCGCAACAATTGCTTTCGCCGCCGCATGATCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996951
ATGGGCTGCTGCGGCGACGACGACGACGACGACGCACCACCACAACCGTCGCAACAATTGCTTTCGCCGCCGCATGATCTCCTCCAGCCGCTCTGTTCCTCATCATCCGCCGACACCACGATCTCGCCGATGAATTCGAATTTCTCGGCTCTCCTATGCAAGGACACTCTCCGGGCCATACTCCAGAAGCTATCGCTCTCCGATCTTGCCCGCGCCTCTTGCGTCTGTCGCCTCTGGCAGTCGGTGGCCTCCGATAGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778220.1
MGCCGDDDDDDAPPQPSQQLLSPPHDLLQPLCSSSSADTTISPMNSNFSALLCKDTLRAILQKLSLSDLARASCVCRLWQSVASDSQMQIQAFISPWKLRDIVGKPSSSAFWRDNSLSKFAVSHRLSRSDSIASLAVKYTAQVMDIKRLNNMMSDHGIYSRERLLIPVNNPEMLVGSTCYIEVDAHAKREVAVLYLEGGPDKNLNSLLHRLATERGKKRVIDSLKRSMRVDDGTALYYLSISNGDPRAALTQFSDDVRWE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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