当前解析结果
SmilChr01G003802| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003802 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003802 |
| 描述 | transcription factor bHLH153-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 56402452 - 56406784 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130996957 |
|---|---|
| GeneID | 130996957 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996957 |
| 原始查询 | LOC130996957 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transcription factor bHLH153-like |
| 产物 | transcription factor bHLH153-like |
| Arabidopsis | AT1G05710 (AT1G05710)basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837078] identity=65.4; qcov=0.878; evalue=6e-53; confidence=high |
| Rice | Os04g0493100 (OsbHLH065)- identity=57; qcov=0.723; evalue=1.11e-37; confidence=medium |
| GO | GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996957 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057778233.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778233.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778233.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778233.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057778233.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:56404276 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C80,D2 |
Chr1:56404285 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,A5,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。