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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004015`

染色体: Chr08 坐标: 48564723-48565471 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004015`
名称	SmilChr08G004015
描述	uncharacterized SmilChr08G004015
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	48564723 - 48565471 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996963`
GeneID	`130996963`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996963`
原始查询	`LOC130996963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0549300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0549300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G25050` (ACP4) acyl carrier protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828608] identity=41.38; qcov=0.966; evalue=9.43e-23; confidence=medium
Rice	`Os08g0549300` - identity=44.44; qcov=0.876; evalue=3.06e-23; confidence=medium
GO	GO:0000036 (acyl carrier activity); GO:0006633 (fatty acid biosynthetic process); GO:0031177 (phosphopantetheine binding)
KEGG	-
Pfam	PF00550 (PP-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996963

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778239.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057778239.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057778239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:48564929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:48565024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B3,B5,C56
`Chr8:48565038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:48565053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B7,B80,C62,D6
`Chr8:48565054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B3,B5,C56
`Chr8:48565089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B71,C70
`Chr8:48565095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C49
`Chr8:48565121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B119,B49,C38
`Chr8:48565155`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B28,B7,B80,C62,D6
`Chr8:48565155`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B28,B7,B80,C62,D6
`Chr8:48565223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C49
`Chr8:48565233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778239.1

145 aa

145

PP-binding

PF00550 PP-binding 71-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778239.1`	Pfam	`PF00550`	PP-binding	Domain	71	136	1.1e-11	45.5	Phosphopantetheine attachment site

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922256.1
TATGTAGAAGAAATAAATCGACATAGTTATGAACGTCAAAGTTTTATAATCTTTCTCAATCTCTTCCCTTTAAATGCACACGAATTTAATCTCCAACCATCACCTCCAAAACCCACACTATATTAATTAATTAATTCATCATATTATTCAATGGCTTCGATTGCTTCTACCGTAAAAGCTCCTCCGCCCGCCGCGGCCCTCAGCCACCGCTCCGTTTCCGGCGCCAAACCCATCGCCGCCGCATTCAGCGCCTCTCCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057778239.1_45180
ATGGCTTCGATTGCTTCTACCGTAAAAGCTCCTCCGCCCGCCGCGGCCCTCAGCCACCGCTCCGTTTCCGGCGCCAAACCCATCGCCGCCGCATTCAGCGCCTCTCCAAGGGCTGCGGGGCTGAGGCTGGCGCCCAAAGCCCGTCAAATCCAGGTGGCGAAAGCCCGAAAGTCGAGGATTTCGTGCACGGCCGCGCAGCTGGAAACCGTGCAGGTGGTGCGGAGCACGATCGCGAAGCAGCTGTCGGTGGAGGAGTGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778239.1
MASIASTVKAPPPAAALSHRSVSGAKPIAAAFSASPRAAGLRLAPKARQIQVAKARKSRISCTAAQLETVQVVRSTIAKQLSVEECTVTPQTKFADLGADSLDTVEIMMALEEKFGVSVGEGGAESIATVQEAANLIEKVKAAAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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