当前解析结果
SmilChr08G000068| 统一新 Gene ID | SmilChr08G000068 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G000068 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G000068 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 389793 - 394717 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130996990 |
|---|---|
| GeneID | 130996990 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130996990 |
| 原始查询 | LOC130996990 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130996990 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057778254.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057778254.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778254.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778254.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778254.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:389824 |
TCG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A5,B120,B129,B18,B25,B55,B76,C10,C53,C57,C61,C65 |
Chr8:390650 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C63 |
Chr8:390650 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C63 |
Chr8:390657 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D1 |
Chr8:390657 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D1 |
Chr8:390687 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 19 | A7,B111,B122,B3,B38,B39,B77,B87,C12,C14,C17,C21,C27,C30,C47,C5,C59,C76,C86 |
Chr8:390716 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A25,A5,B120,B129,B59,B79,B94,C56,C7,C72 |
Chr8:390744 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B11,B121,B29,B43,C3,D6,D7 |
Chr8:390756 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B99 |
Chr8:390756 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr8:390763 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 67 | A15,A7,B102,B108,B111,B112,B119,B120,B19,B20,B28,B34,B5,B50,B52,B55,B56,B57,B58,B60,B62,B64,B69,B73,B74,B75,B88,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C10,C14,C19,C21,C23,C24,C32,C40,C42,C44,C52,C55,C56,C57,C58,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C68,C69,C71,C73,C8,C81,C83,C85,C86,C87,D10,D6,D8 |
Chr8:390814 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B29,B42,B6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。