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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000150`

染色体: Chr08 坐标: 968839-970663 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000150`
名称	SmilChr08G000150
描述	disease resistance protein RGA2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	968839 - 970663 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997006`
GeneID	`130997006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997006`
原始查询	`LOC130997006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RGA2-like
产物	disease resistance protein RGA2-like
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=30.2; qcov=0.993; evalue=2.13e-57; confidence=low
Rice	`Os08g0543500` - identity=33.7; qcov=0.848; evalue=6.18e-72; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057778268.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057778268.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778268.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778268.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778268.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:968960`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A22,B101,B108,B138,C41,C47,C50
`Chr8:968963`	`CTT`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	C1,C31,C4,C49
`Chr8:968969`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A22,B101,B108,B138,C41,C47,C50
`Chr8:968985`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	79	A1,A10,A14,A16,A18,A22,A23,A3,A9,B104,B109,B11,B118,B120,B127,B13,B131,B135,B139,B16,B18,B19,B23,B24,B26,B27,B33,B38,B39,B42,B43,B44,B45,B47,B5,B52,B57,B6,B60,B63,B65,B69,B7,B74,B78,B8,B82,B86,B94,C1,C14,C23,C29,C32,C33,C38,C39,C40,C41,C45,C50,C58,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C74,C75,C77,C78,C8,C80,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr8:968989`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	74	A1,A10,A14,A16,A22,A23,A3,A9,B104,B109,B11,B118,B120,B127,B13,B131,B135,B139,B16,B18,B19,B23,B24,B25,B26,B27,B33,B38,B39,B43,B44,B45,B47,B5,B52,B57,B60,B63,B65,B69,B7,B74,B78,B8,B82,B86,B94,C1,C14,C23,C29,C32,C33,C38,C39,C40,C41,C45,C50,C58,C65,C66,C68,C7,C74,C75,C77,C78,C8,C80,D3,D5,D8,D9
`Chr8:968994`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B11,B48,C1,C17,C31,C4,C49
`Chr8:969047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr8:969068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr8:969093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr8:969169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C50,C53,D3
`Chr8:969172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B26,B33,C28,C58,C64,C66,C87
`Chr8:969174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,C28,C50,C58,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778268.1

553 aa

276

553

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

PF18052 Rx_N 63-107 aa PF00931 NB-ARC 193-340 aa PF23559 WHD_DRP 421-492 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778268.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	63	107	1e-08	35.9	Rx N-terminal domain
`XP_057778268.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	193	340	2.3e-32	112.6	NB-ARC domain
`XP_057778268.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	421	492	1.2e-25	90.1	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922285.1
ATGAAAGGCTTCCTCTTTCTCTTTCTCACTCAATTTCTCTCTTTCTCCCTCTCTCTGTCTAAGTTATCAGCACAACAGTTAAAGAATGGAAGGAGAAGCTGCTGCCGCCGTCCTTCAAGCTCTAGTTCAAAACCTCATCGACCTCTGCAAGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGATCTCTCAAATCCGAGAAGCGTGACATCACCAGCGAAGCTGTCAAGAGCTGGCTGGAGAATCTTGAAAACGTGGCGTTCGATGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997006
ATGAAAGGCTTCCTCTTTCTCTTTCTCACTCAATTTCTCTCTTTCTCCCTCTCTCTGTCTAAGTTATCAGCACAACAGTTAAAGAATGGAAGGAGAAGCTGCTGCCGCCGTCCTTCAAGCTCTAGTTCAAAACCTCATCGACCTCTGCAAGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGATCTCTCAAATCCGAGAAGCGTGACATCACCAGCGAAGCTGTCAAGAGCTGGCTGGAGAATCTTGAAAACGTGGCGTTCGATGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778268.1
MKGFLFLFLTQFLSFSLSLSKLSAQQLKNGRRSCCRRPSSSSSKPHRPLQERDLSNPRSLKSEKRDITSEAVKSWLENLENVAFDADNVLDEVNYHILSKQIKPAEPEKEKVPSCFSCFKHISRSRNMALKIKEINENLEFINKEAAKLGLVEKLANEPALVIAALETDSYTLDPIFIGRDNVDYHHFHCRDGGLGKTTLTRKVFNRLKNENRFGSHIWVHVSPNFDAITLFKKILKELTSSDGVEVESKQDILSKLEEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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