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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000157`

染色体: Chr08 坐标: 1044938-1047022 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000157`
名称	SmilChr08G000157
描述	probable disease resistance protein At4g27220
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1044938 - 1047022 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997011`
GeneID	`130997011`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997011`
原始查询	`LOC130997011`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At4g27220
产物	probable disease resistance protein At4g27220
Arabidopsis	`AT4G27220` (AT4G27220) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828830] identity=27.8; qcov=0.607; evalue=7.89e-20; confidence=low
Rice	`Os01g0788500` - identity=33.6; qcov=0.304; evalue=2.07e-17; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13855 (LRR_8); PF23247 (LRR_RPS2); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997011

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057778273.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778273.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057778273.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778273.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778273.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1045013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B97,C31,C39,C60
`Chr8:1045083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr8:1045126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr8:1045273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr8:1045382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr8:1045532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B65
`Chr8:1045608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:1045615`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	42	A19,A20,A3,A4,A5,B1,B10,B103,B108,B112,B113,B119,B126,B129,B13,B138,B139,B18,B20,B21,B22,B26,B28,B33,B46,B58,B62,B72,B75,B77,B83,C19,C20,C22,C23,C30,C32,C49,C50,C54,C68,C74
`Chr8:1045616`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	B104,B126,B128,B140,B34,B44,B52,B54,B55,B57,B65,B73,B89,C11,C12,C24,C30,C34,C44,C55,C6,C69,D11,D4
`Chr8:1045617`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A10,A18,A23,A6,A7,B118,B132,B135,B14,B68,B71,B74,B80,B82,B87,B90,B92,B94,B96,B97,B98,C13,C27,C31,C33,C36,C39,C45,C60,C75,D3,D7,D9
`Chr8:1045692`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr8:1045692`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778273.1

694 aa

347

694

LRR_14

LRR_8

LRR_RPS2

PF23598 LRR_14 199-408 aa PF13855 LRR_8 205-263 aa PF23247 LRR_RPS2 513-587 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778273.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	199	408	4.3e-19	69.2	Leucine-rich repeat region
`XP_057778273.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	205	263	3.6e-10	40.2	Leucine rich repeat
`XP_057778273.1`	Pfam	`PF23247`	LRR_RPS2	Repeat	513	587	5e-15	56.5	Plant disease resistance protein RPS2-like, leucine-rich repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922290.1
ATGATTAGCCCCACTTCAGAAAGGTCCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGGTGGTGAAACTCGTGAGGCTGTCGAATCTCCTCACGTGCATGATGCTGTGACTTCACAAGTCCAAGAATATGAGAACAAATGGGATGCACCAAAAGTGCCCGGTGTTGTGACTTCACAAATCCAAGAACATGAGAACAAATCGAAAGAACCAAAATATGAAAAGATGACATCGAATCCACCAGAGGTGAGCAAACACCAGCAAGATCAAAGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997011
ATGATTAGCCCCACTTCAGAAAGGTCCGGCGGCGGCAGCGGCGGCGGTGGTGAAACTCGTGAGGCTGTCGAATCTCCTCACGTGCATGATGCTGTGACTTCACAAGTCCAAGAATATGAGAACAAATGGGATGCACCAAAAGTGCCCGGTGTTGTGACTTCACAAATCCAAGAACATGAGAACAAATCGAAAGAACCAAAATATGAAAAGATGACATCGAATCCACCAGAGGTGAGCAAACACCAGCAAGATCAAAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778273.1
MISPTSERSGGGSGGGGETREAVESPHVHDAVTSQVQEYENKWDAPKVPGVVTSQIQEHENKSKEPKYEKMTSNPPEVSKHQQDQSVDDIGFARVGESELGMTFKFVLSMSESEGLNIRLQMLSMSSRQTQETALNLGTAMDNYRLFSATREVAVELDKNGVIVNRNGSKQPREMPTAEEWGEARVVNLIERKNMLLNDEAPNCPNLLILFLQRNSRLTRIPSSFFTQMPRLNFLDLSYTRIKALPSSLFKLQNLQILLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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