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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000202`

染色体: Chr08 坐标: 1375570-1382145 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000202`
名称	SmilChr08G000202
描述	uncharacterized SmilChr08G000202
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1375570 - 1382145 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997028`
GeneID	`130997028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997028`
原始查询	`LOC130997028`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778289.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057778289.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778289.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778289.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778289.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1375589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A3,B111,B124,B51,B66,B69,B77,B79,B93,C22
`Chr8:1375590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	92	A16,A2,A20,A23,A24,A3,A7,B103,B105,B108,B112,B113,B118,B119,B12,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B136,B14,B15,B17,B18,B2,B22,B27,B3,B33,B37,B38,B42,B44,B47,B49,B51,B54,B55,B57,B63,B64,B66,B70,B73,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B83,B93,B94,B97,B98,C10,C15,C16,C18,C2,C22,C28,C3,C32,C37,C41,C45,C47,C49,C53,C54,C55,C56,C59,C60,C63,C64,C66,C73,C76,C78,C81,C82,C83,C86,C87,D1,D2,D7,D8
`Chr8:1375600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	56	A13,A15,A16,A23,B1,B104,B105,B11,B111,B113,B120,B124,B135,B14,B140,B18,B20,B22,B25,B27,B30,B31,B4,B40,B42,B69,B72,B75,B76,B8,B84,B86,B87,B88,B99,C1,C14,C18,C2,C25,C33,C35,C38,C39,C66,C71,C78,C79,C8,C81,C82,C84,C85,D2,D3,D6
`Chr8:1375601`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A4,B101,B114,B17,B30,B31,B46,B54,B65,B78,B90,B96,C3,C66,D9
`Chr8:1375636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr8:1375649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D4
`Chr8:1375654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A9,B10,B119,B125,B132,B5,B54,B71,B81,B94,C22,C31,C47,C55,C57,C77,C85,C87,D8
`Chr8:1375663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A20,B112,B132,B42,B43,B84,C10,C39,C47,C67,C84
`Chr8:1375666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:1375675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B104,B110,B32,B35,B6,B80,C15,C25,C27,C67,C84
`Chr8:1375690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	B111,B112,B132,B34,B35,B50,B52,B60,B8,B84,B93,B95,C2,C22,C37,C39,C43,C47,C54,C56,C61,C64,C67,C79,C83,C84,D11
`Chr8:1375727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B54,C3,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778289.1

188 aa

188

Helitron_like_N

PF14214 Helitron_like_N 1-72 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778289.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	1	72	2.4e-26	93.8	Helitron helicase-like domain at N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922306.1
ATGACTTGCAATCCAGAGTGGAAAGAAATACAAGAAGCATTATATGATGGTCAAACAGCTCAAGATCGTCCAGACTTAACTACACGAGTATTTCGAGCAAAACTGCAAGACTTGAAAGATCAATTATTCAAGAGGAAATTTTTTGGACATGTAGCTGCACATGTTGATGTAGTTGAATTTCAAAAGAGAGGGTTACCACATGTCCACATGCTGATAATTTTCAAGTCCGAGCATAAGTTGAATACGACAAGTGAAATAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997028
ATGACTTGCAATCCAGAGTGGAAAGAAATACAAGAAGCATTATATGATGGTCAAACAGCTCAAGATCGTCCAGACTTAACTACACGAGTATTTCGAGCAAAACTGCAAGACTTGAAAGATCAATTATTCAAGAGGAAATTTTTTGGACATGTAGCTGCACATGTTGATGTAGTTGAATTTCAAAAGAGAGGGTTACCACATGTCCACATGCTGATAATTTTCAAGTCCGAGCATAAGTTGAATACGACAAGTGAAATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778289.1
MTCNPEWKEIQEALYDGQTAQDRPDLTTRVFRAKLQDLKDQLFKRKFFGHVAAHVDVVEFQKRGLPHVHMLIIFKSEHKLNTTSEIDKFENANAIIHDHIVKAHNKVKMDIQFTKEEKMDQLYMHVQNADLDNQWVVPYNAHLLSRYNCHINVEVLEKMVDFEKSFEVVKLCEEEAVNGHAEFCLDEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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