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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000234`

染色体: Chr08 坐标: 1594398-1594945 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000234`
名称	SmilChr08G000234
描述	uncharacterized SmilChr08G000234
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1594398 - 1594945 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997034`
GeneID	`130997034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997034`
原始查询	`LOC130997034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	YR1; symbol=YR1; hit=Os05g0492200; species=rice; confidence=low
产物	YR1; symbol=YR1; hit=Os05g0492200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=26.1; qcov=0.982; evalue=4.05e-06; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=28.5; qcov=0.878; evalue=1.88e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778296.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778296.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778296.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778296.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778296.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1594459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C34
`Chr8:1594502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B101
`Chr8:1594528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,D1
`Chr8:1594535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B29,C38,D1
`Chr8:1594571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C64
`Chr8:1594584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B6,C78,C81
`Chr8:1594585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr8:1594595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:1594600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,C31,C60,C62
`Chr8:1594601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B23,B3,C10,C38
`Chr8:1594603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr8:1594662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778296.1

164 aa

164

Rx_N

PF18052 Rx_N 9-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778296.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	9	96	4.4e-22	78.7	Rx N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922313.1
ATGGAAGCAGCAGCTGCTACCGCGGTCCTTAAAGTTCTAGTTGAAAAACTCATCGACCTCCCCATGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGGTTTCCGCAAAAATGCAGAAAAGCTAGCTGGAAGTCTCGACATGATCCAGAAATTCTTGCACAATGCTGAGATGCGTGCCATCACCAGCGATGCTGCTGTCAAGAGCTGGTTGAAGAAGCTTGAAGACGTGGCGTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATGAAATCAACTATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997034
ATGGAAGCAGCAGCTGCTACCGCGGTCCTTAAAGTTCTAGTTGAAAAACTCATCGACCTCCCCATGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGGTTTCCGCAAAAATGCAGAAAAGCTAGCTGGAAGTCTCGACATGATCCAGAAATTCTTGCACAATGCTGAGATGCGTGCCATCACCAGCGATGCTGCTGTCAAGAGCTGGTTGAAGAAGCTTGAAGACGTGGCGTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATGAAATCAACTATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778296.1
MEAAAATAVLKVLVEKLIDLPMKEISQIRGFRKNAEKLAGSLDMIQKFLHNAEMRAITSDAAVKSWLKKLEDVAFDADNVLDEINYHILSKQIKATKPMKAKILSGFSSSVNSIARPRNMAVRIKKINKNLKSIKKEATDLGLVVRLAIANEPTLVDASLETDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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