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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000249`

染色体: Chr08 坐标: 1726933-1727505 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000249`
名称	SmilChr08G000249
描述	putative disease resistance protein RGA4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1726933 - 1727505 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997044`
GeneID	`130997044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997044`
原始查询	`LOC130997044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA4
产物	putative disease resistance protein RGA4
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=25.9; qcov=0.732; evalue=9.9e-08; confidence=low
Rice	`Os05g0380300` (A1.1-4) - identity=28.6; qcov=0.847; evalue=8.98e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778307.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778307.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778307.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778307.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1726979`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B18
`Chr8:1726979`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B18
`Chr8:1727042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr8:1727118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr8:1727155`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C14
`Chr8:1727155`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C14
`Chr8:1727186`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr8:1727186`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr8:1727189`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr8:1727189`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr8:1727210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B18,C3
`Chr8:1727212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778307.1

190 aa

190

Rx_N

PF18052 Rx_N 8-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778307.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	8	97	8e-21	74.7	Rx N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922324.1
ATGGAAGGAGGAGCTGCTGCTGCCGTTGAAGTTCTAGTTCAAAACCTCATCGACCTTTCCAAGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGGTCTCGACAAAGATGCAGCAAAGCTAGCTGGGAGTCTCGACGTGATCAAAAATTTCTTGAAGGATGCCGAGACGCGTGAGATCACCAGCGATGCTGTCAAGAGCTGGCTGAAGAAGCTTGAAAACGAGGCGTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATGAAATCAACTATCATATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997044
ATGGAAGGAGGAGCTGCTGCTGCCGTTGAAGTTCTAGTTCAAAACCTCATCGACCTTTCCAAGAAAGAGATCTCTCAAATCCGAGGTCTCGACAAAGATGCAGCAAAGCTAGCTGGGAGTCTCGACGTGATCAAAAATTTCTTGAAGGATGCCGAGACGCGTGAGATCACCAGCGATGCTGTCAAGAGCTGGCTGAAGAAGCTTGAAAACGAGGCGTTCGATGCTGACAATGTTTTGGATGAAATCAACTATCATATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778307.1
MEGGAAAAVEVLVQNLIDLSKKEISQIRGLDKDAAKLAGSLDVIKNFLKDAETREITSDAVKSWLKKLENEAFDADNVLDEINYHILSKQIKPAEPMKAKVLSCFSSSFNSIARRRKMAVRIQEINENLESIKKEATELGLVAKLENEPTLVNTAIFETDSFTLDPIFIGREDVTSKIVEMLDILSSGNC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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