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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000259`

染色体: Chr08 坐标: 1786085-1787465 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000259`
名称	SmilChr08G000259
描述	uncharacterized SmilChr08G000259
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	1786085 - 1787465 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997046`
GeneID	`130997046`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997046`
原始查询	`LOC130997046`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=58.4; qcov=0.437; evalue=4.59e-70; confidence=low
Rice	`Os08g0106900` - identity=43.7; qcov=0.768; evalue=5.7e-86; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997046

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778309.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057778309.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057778309.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778309.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778309.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:1786133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:1786158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,A9,B11,C4,C65
`Chr8:1786193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A22,B21,B53,B57,C12,C14,C61,C62
`Chr8:1786196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B49,C14,C44
`Chr8:1786202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B27,B81,C20,C47
`Chr8:1786233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B134,B70,C15
`Chr8:1786257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B70,C15
`Chr8:1786268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:1786303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D1
`Chr8:1786305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B28,C28,C48,C5
`Chr8:1786324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr8:1786349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778309.1

435 aa

218

435

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 71-161 aa PF01609 DDE_Tnp_1 191-337 aa PF13359 DDE_Tnp_4 197-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778309.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	71	161	9.7e-23	80.6	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057778309.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	191	337	4.6e-11	43.6	Transposase DDE domain
`XP_057778309.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	197	358	2e-25	90.0	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922326.1
ATGAATTATGAAGATAAAATTAACATTGCAATTGAAGAAGACATAGATGAAGAACTTGATGATGAAATCGAAACAGAGATGGAGATTGAACTTTCTGTTCATGCTAGGCAACTGATGGAAGCAGCTAAGGTAGTTATCACTCTAGTGGGAAATATTATGACGCATCATCCGACTGCTGACAATGCTCTGATGCGACGACCAAAGACTAGGGAAGGATTCCGTTTTATTACGGGAATGATGGATGGAGATCCGAGCCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997046
ATGAATTATGAAGATAAAATTAACATTGCAATTGAAGAAGACATAGATGAAGAACTTGATGATGAAATCGAAACAGAGATGGAGATTGAACTTTCTGTTCATGCTAGGCAACTGATGGAAGCAGCTAAGGTAGTTATCACTCTAGTGGGAAATATTATGACGCATCATCCGACTGCTGACAATGCTCTGATGCGACGACCAAAGACTAGGGAAGGATTCCGTTTTATTACGGGAATGATGGATGGAGATCCGAGCCAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778309.1
MNYEDKINIAIEEDIDEELDDEIETEMEIELSVHARQLMEAAKVVITLVGNIMTHHPTADNALMRRPKTREGFRFITGMMDGDPSQFRQLYRMYPDVFIKLCQIIREKAHVDDTRYTTVEEMLATFLIIVGHNDRYCNVRERFGRSHFAASRNFNKILRALNTIAPDMMFKPTGAIPAKIRESTRFYPYFKDCIGAIDGTHIPATIIGKDVSCYRNRHGVNSQNVLAACNFDLQFIYVLSGWEGSAHDSKILSDALSRPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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