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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003684`

染色体: Chr08 坐标: 41108126-41112658 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003684`
名称	SmilChr08G003684
描述	digalactosyldiacylglycerol synthase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41108126 - 41112658 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997071`
GeneID	`130997071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997071`
原始查询	`LOC130997071`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	digalactosyldiacylglycerol synthase 1, chloroplastic
产物	digalactosyldiacylglycerol synthase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G11670` (DGD1) UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820339] identity=69.9; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0539100` - identity=64.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009707 (chloroplast outer membrane); GO:0019375 (galactolipid biosynthetic process); GO:0046481 (digalactosyldiacylglycerol synthase activity)
KEGG	smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00534 (Glycos_transf_1); PF13692 (Glyco_trans_1_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057778325.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057778325.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057778325.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778325.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41108408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:41108507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:41108797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B20,C26
`Chr8:41110145`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr8:41110145`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr8:41110333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr8:41110338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C23,C31
`Chr8:41111945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B64,B81,C26,C44
`Chr8:41112044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:41112434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B111,B79,C20,C43
`Chr8:41112441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B118,B125
`Chr8:41112445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778325.1

796 aa

398

796

Glycos_transf_1

Glyco_trans_1_4

PF00534 Glycos_transf_1 555-690 aa PF13692 Glyco_trans_1_4 556-685 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778325.1`	Pfam	`PF00534`	Glycos_transf_1	Domain	555	690	4e-13	50.0	Glycosyl transferases group 1
`XP_057778325.1`	Pfam	`PF13692`	Glyco_trans_1_4	Domain	556	685	1.5e-11	45.5	Glycosyl transferases group 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922342.1
ATTCATATTTCCAAAATATAAGCAAATAAAAACATACCGCAATCTTAGCCGTTAAAACTCTCACACAACACAACTCCTTCCTTCGCCATTCACACTCTCTCCTTTCATCGGAAAATTCAATTTACCCTAAATTTTACTCGGAATTGTCGGCGAATTTAGAATCCGAGCATGAATTTCAAGCCGCCGGAGTCGCGGTCGGCCTCCACGACGGCGCGGCCGTCCGGCTCCATCGTGACGGCGGAGAAGGCCTTCTCCTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997071
ATGAATTTCAAGCCGCCGGAGTCGCGGTCGGCCTCCACGACGGCGCGGCCGTCCGGCTCCATCGTGACGGCGGAGAAGGCCTTCTCCTTCATATCCAAGGGCTGGCGCGAGGTCCGCTCCTCAGCCGACGCCGATCTTCAACTGCTCAAAAACCGCGCCAACTCCTTCAAAAACCTAGCCGATAAGGAGCTCGAGAATTTCCTCAACTCCGCCTCGAGGACGCCCTTCAGTGTCCCCACAATTACCGCCTCCGCCACTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778325.1
MNFKPPESRSASTTARPSGSIVTAEKAFSFISKGWREVRSSADADLQLLKNRANSFKNLADKELENFLNSASRTPFSVPTITASATLNPAPPAEIDFVKKLQPKLSEFRRAYSSPDFKFYPRPQIKINLSAIKNAIVAEVGEDEDEEDERETLRKWRGVRLKEKEREEGQFGEFWEPIRTFKSRLRELEQKSSSEILEGIKNSEFVEKFKSSLKSICKDPNDSKEVPPLDVPELLACLVRQSSPFLDQLGIGRGISDKIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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