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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003692`

染色体: Chr08 坐标: 41266924-41270468 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003692`
名称	SmilChr08G003692
描述	receptor protein kinase TMK1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	41266924 - 41270468 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997075`
GeneID	`130997075`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997075`
原始查询	`LOC130997075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor protein kinase TMK1-like
产物	receptor protein kinase TMK1-like
Arabidopsis	`AT2G01820` (AT2G01820) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814713] identity=47.5; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0685900` (OsRLCK174) - identity=55.4; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997075

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778330.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778330.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778330.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778330.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778330.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:41267435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D7
`Chr8:41267456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:41267481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A3,C48
`Chr8:41267561`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B23,C16,C53,C9
`Chr8:41267561`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B23,C16,C53,C9
`Chr8:41267588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:41267645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:41267783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:41268006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:41268295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B22,B27,D4,D6
`Chr8:41268322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:41268563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778330.1

944 aa

472

944

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRRNT_2

LRR_1

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF08263 LRRNT_2 32-71 aa PF00560 LRR_1 198-218 aa PF00560 LRR_1 246-268 aa PF13855 LRR_8 246-304 aa PF00560 LRR_1 270-290 aa PF08263 LRRNT_2 338-372 aa PF00560 LRR_1 400-422 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 597-870 aa PF00069 Pkinase 597-871 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778330.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	32	71	1.1e-14	55.1	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057778330.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	198	218	2.1e-18	63.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057778330.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	246	268	2.1e-18	63.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057778330.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	246	304	1.9e-23	82.7	Leucine rich repeat
`XP_057778330.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	270	290	2.1e-18	63.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057778330.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	338	372	1.1e-14	55.1	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057778330.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	400	422	2.1e-18	63.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057778330.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	597	870	2.6e-45	155.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057778330.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	597	871	2.5e-44	152.4	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922347.1
AAAAGACAAAAACACCCTTCTCCCTCGTTCCAGCACAAAATCAGCCAACACCCAAAATCCGAAAGTAACCACTTATTTTCCATGATTTAACAGTCACATTTGTCAAAGCAATTTCAACATTTCCTTTTCCTCTTCCTTAATTTATCCTTTTCCTCTCTCGATCTGCATTTCTCTTCAAAGACCCACTTTCTCGTTCAACAATCTTGGCTTGAAAGTCTCTCCATTCCCCAATTTTTTAATTAATTCTCTGGTGTTTTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997075
ATGGCGGCTGCTACCCAGATAACAAAACTCGCCGCAGCAGCCTTCTTCCTCTTCACCTTCTCAGCCGCTGTCGTTCACAGCGCTACGACGGACCCGGGCGATTTAGCCGTGCTGAATCAGTTCAGAAAAAATCTCGAAAATGCGGAGCTTCTGCAATGGCCTGCCAATGGCGGCGACCCATGTGGGCCCCCCAGCTGGCCCCACGTCTTCTGCGAAAACGGAAGAGTGACTCAGATTCAGGTGCGGGGTTTAGGTCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778330.1
MAAATQITKLAAAAFFLFTFSAAVVHSATTDPGDLAVLNQFRKNLENAELLQWPANGGDPCGPPSWPHVFCENGRVTQIQVRGLGLKGPLPENFNQLSKLFNIGLQRNQFTGKLPSFSGLSELKYAYLDNNNFETIPSDFFDGLVNLEAMALDYNPLNATTGWSLPEALRGSAQLTNLTLMGCNLAGPLPEFLGTMSSLQVLRLSKNRLSGSIPASFKGSVLAELWLNEQTVGMSGSIEIVATMASLTSLWLHGNHFTGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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