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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003728`

染色体: Chr08 坐标: 42105641-42108962 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003728`
名称	SmilChr08G003728
描述	2-Cys peroxiredoxin BAS1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	42105641 - 42108962 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997102`
GeneID	`130997102`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997102`
原始查询	`LOC130997102`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-Cys peroxiredoxin BAS1, chloroplastic-like
产物	2-Cys peroxiredoxin BAS1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G06290` (2-Cys Prx B) 2-cysteine peroxiredoxin B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830517] identity=88.6; qcov=0.798; evalue=2.33e-137; confidence=high
Rice	`Os02g0537700` (OsPRX2) - identity=73.3; qcov=1.01; evalue=5.63e-134; confidence=high
GO	GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0008379 (thioredoxin peroxidase activity); GO:0033554 (cellular response to stress); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process); GO:0045454 (cell redox homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin); PF10417 (1-cysPrx_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997102

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778350.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057778350.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778350.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778350.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778350.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:42106103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:42107613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778350.1

263 aa

132

263

AhpC-TSA

Redoxin

1-cysPrx_C

PF00578 AhpC-TSA 72-205 aa PF08534 Redoxin 72-208 aa PF10417 1-cysPrx_C 226-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778350.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	72	205	2.5e-41	141.2	AhpC/TSA family
`XP_057778350.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	72	208	6.1e-14	52.8	Redoxin
`XP_057778350.1`	Pfam	`PF10417`	1-cysPrx_C	Domain	226	260	2.1e-11	44.3	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922367.1
CCAGCCCACAACACTCCCAGAAACGACGCAGTTTCGTCACTTATCTTCTCCTTCTCCCTTTCAACCAGTCTCCACCTTAAGATCCCAAACTACTCTCCTATTTATTCATCGCTGTAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAAAGCGCCCAAATCAGCAACAATGGCGTGCGTGGCTGGTGCTTCAATGGCTGCTGTCGTCCCATCCAATCTCAATCCCAAAGCCTGCATTTCTTCCCTAAAGCCCGTTTCTCGGCGGCCCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997102
ATGGCGTGCGTGGCTGGTGCTTCAATGGCTGCTGTCGTCCCATCCAATCTCAATCCCAAAGCCTGCATTTCTTCCCTAAAGCCCGTTTCTCGGCGGCCCATTTCCCTTCATTCCTCCTTCTCCGGCAAGCCCGTCGTCTCTCGTACCCCTCGCTCTCTCTCTTCCGCCTCGAGACGACGAATTTTGGTTGTGCGCGCCAGTGAAGTTCCGTTGGTTGGAAATGTAGCTCCAGATTTTGAGGCAGAAGCTGTTTTTGATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778350.1
MACVAGASMAAVVPSNLNPKACISSLKPVSRRPISLHSSFSGKPVVSRTPRSLSSASRRRILVVRASEVPLVGNVAPDFEAEAVFDQEFVRVKLSDYFKKKYVILFFYPLDFTFVCPTEITAFSDRHGEFEKLNTEILGVSVDSVFSHLAWVQTDRKSGGLGDLAYPLVSDVTKSISKSYGVLIPDQGIALRGLFIIDKEGVIQHSTINNLAIGRSVDETLRTLQALQYVQENPDEVCPAGWKPGEKSMKPDPKLSKEYF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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