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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003739`

染色体: Chr08 坐标: 42315300-42322456 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003739`
名称	SmilChr08G003739
描述	D-lactate dehydrogenase [cytochrome], mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	42315300 - 42322456 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997108`
GeneID	`130997108`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997108`
原始查询	`LOC130997108`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	D-lactate dehydrogenase [cytochrome], mitochondrial
产物	D-lactate dehydrogenase [cytochrome]%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G06580` (AT5G06580) FAD-linked oxidases family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830546] identity=78.3; qcov=0.891; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0163000` (OsD-LDH) - identity=79; qcov=0.823; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004458 (D-lactate dehydrogenase (cytochrome) activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0008720 (D-lactate dehydrogenase (NAD+) activity); GO:0071949 (FAD binding); GO:1903457 (lactate catabolic process)
KEGG	smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF02913 (FAD-oxidase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997108

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778356.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057778356.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057778356.1`
4	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057778356.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:42315584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:42316658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:42318600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:42318894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:42319004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:42319414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:42321348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B91,C14
`Chr8:42322102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778356.1

586 aa

293

586

FAD_binding_4

FAD-oxidase_C

PF01565 FAD_binding_4 165-302 aa PF02913 FAD-oxidase_C 338-579 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778356.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	165	302	3.8e-39	134.3	FAD binding domain
`XP_057778356.1`	Pfam	`PF02913`	FAD-oxidase_C	Domain	338	579	1.6e-71	241.7	FAD linked oxidases, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922373.1
GCACCAATTAATAGGTAAATTGGAACTGGAGATTGAATCCGAAAGAGGAAATGAAGAACCAGTGGTATTATTTAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAGCACATGTAGCCGCTGTACATGTACTGTAAGTACTCTTCAATCCGGCGCCGCGTTTGGCTTTTAACAATGGCGCTGTCTTCGTGGATTTCTCGATTGCGTTCTTCCTCAAGACCTATTTACACCAAATTCCGGAACTCTCTCTCTCACGACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997108
ATGTACTGTAAGTACTCTTCAATCCGGCGCCGCGTTTGGCTTTTAACAATGGCGCTGTCTTCGTGGATTTCTCGATTGCGTTCTTCCTCAAGACCTATTTACACCAAATTCCGGAACTCTCTCTCTCACGACCACGGAGCCGCCGTGACAGGGAGCCCTGCTGCGGTGGAACGCTTCCGGAAACCGTCCTTTTCGCATTGGGATAACTCTTTGCTTCCGCTGGCTTTCGCTCTCTCCGCCGGCTCTCTTGCTTTGCATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778356.1
MYCKYSSIRRRVWLLTMALSSWISRLRSSSRPIYTKFRNSLSHDHGAAVTGSPAAVERFRKPSFSHWDNSLLPLAFALSAGSLALHSYFNNSPSCCEAPNLDQTDKRLGGTDSMNYVVKGSHREVPQELINELSVICKENMTMDYDERYYHGKPQNSFHKAVNIPDIIVFPRSEEEVSKIVASCNKHKVPIVPYGGATSIEGHTLSPNGGVCIDMTQMKRIKSLNVKDMDVVVEPGIGWMDLNEYLEPYGLFFPLDPGPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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