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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003750`

染色体: Chr08 坐标: 42540581-42546643 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003750`
名称	SmilChr08G003750
描述	uncharacterized SmilChr08G003750
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	42540581 - 42546643 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997117`
GeneID	`130997117`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997117`
原始查询	`LOC130997117`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	downstream neighbor of Son [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824640]; symbol=AT3G54750; hit=AT3G54750; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	downstream neighbor of Son [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824640]; symbol=AT3G54750; hit=AT3G54750; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G54750` (AT3G54750) downstream neighbor of Son [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824640] identity=40.2; qcov=0.982; evalue=8.24e-145; confidence=medium
Rice	`Os12g0621700` - identity=40.2; qcov=0.995; evalue=1.12e-130; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0033260 (nuclear DNA replication)
KEGG	-
Pfam	PF27662 (DONSON)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997117

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778359.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778359.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778359.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778359.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:42541038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:42542009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C65
`Chr8:42543368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B24,C65
`Chr8:42544121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:42544188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B24,C65
`Chr8:42544483`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C77
`Chr8:42544483`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C77
`Chr8:42544499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778359.1

628 aa

314

628

DONSON

PF27662 DONSON 234-403 aa PF27662 DONSON 417-600 aa

XP_057778360.1

628 aa

314

628

DONSON

PF27662 DONSON 234-403 aa PF27662 DONSON 417-600 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778359.1`	Pfam	`PF27662`	DONSON	Domain	234	403	1.4e-46	160.3	Protein downstream neighbor of Son
`XP_057778359.1`	Pfam	`PF27662`	DONSON	Domain	417	600	1.4e-46	160.3	Protein downstream neighbor of Son
`XP_057778360.1`	Pfam	`PF27662`	DONSON	Domain	234	403	1.4e-46	160.3	Protein downstream neighbor of Son
`XP_057778360.1`	Pfam	`PF27662`	DONSON	Domain	417	600	1.4e-46	160.3	Protein downstream neighbor of Son

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922376.1
GATCCGATCGCAATGTTAGTTCACAAAAAGAGGGAAACAAATAATTCAAATCAATCCAAAACCAAATTTGCCTCCCTCTTTCAATTAATCCAGCCGCGCTCTCCACAAATTTCAGCTACTCTCCGCCACCCACACTCACCGGAACACACGAATGATTTCAACAAATATCTGATTGCCGACGTCGCTGCACACTACAGTTGCTCGCGGAGAGGATGAGTAATGTTGCGACAGCCGGTCAATTGCCTATGCCTAATAATCTT...

XM_057922377.1
CGCAATGTTAGTTCACAAAAAGAGGGAAACAAATAATTCAAATCAATCCAAAACCAAATTTGCCTCCCTCTTTCAATTAATCCAGCCGCGCTCTCCACAAATTTCAGCTACTCTCCGCCACCCACACTCACCGGAACACACGAATGATTTCAACAAATATCTGATTGCCGACGTCGCTGCACACTACAGATTGAGGACGAGTTTAATTTCTTCTCCCGATTTGAGTTATGCTTGTGTGCGTGGATCTTAAGGATTGTGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997117
ATGAGTAATGTTGCGACAGCCGGTCAATTGCCTATGCCTAATAATCTTCACTATGGGGGTGTGGCTGCCGGAGGAGTTTCTAAGACCAAATTGAAGCGGAAAACTCCCTCGGAGTTGAGGGGGGAATTACTGAAGAAAAAGAGTCTACTGGAGGGTTCAGACGAGTCCCCAACTTTTACTGGTTCCATGAGGAATGCTGATGAAGCAGTTTCTGGGAGCAACAAATCTGATTCATTGAAGGCAGCACGATTCAGAAGGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778359.1
MSNVATAGQLPMPNNLHYGGVAAGGVSKTKLKRKTPSELRGELLKKKSLLEGSDESPTFTGSMRNADEAVSGSNKSDSLKAARFRRMDEHYPVTKTSRLFCRKENLKENVPSKSVGSMKNSSFTLDSNDKHEVQNSCLEGTVASEGGNNTSRQTNHSSENCTTNAFKSVRELSLGGGMRSNSSSVDMGKALKGLVSCEPHAASAPLPQPMHRSGNIVQQRLSEIHIPGRKSPLDLTLKTSMRVLLSSSVNWFHRLINCAT...

XP_057778360.1
MSNVATAGQLPMPNNLHYGGVAAGGVSKTKLKRKTPSELRGELLKKKSLLEGSDESPTFTGSMRNADEAVSGSNKSDSLKAARFRRMDEHYPVTKTSRLFCRKENLKENVPSKSVGSMKNSSFTLDSNDKHEVQNSCLEGTVASEGGNNTSRQTNHSSENCTTNAFKSVRELSLGGGMRSNSSSVDMGKALKGLVSCEPHAASAPLPQPMHRSGNIVQQRLSEIHIPGRKSPLDLTLKTSMRVLLSSSVNWFHRLINCAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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