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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000513`

染色体: Chr08 坐标: 3738525-3738995 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000513`
名称	SmilChr08G000513
描述	uncharacterized SmilChr08G000513
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	3738525 - 3738995 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997140`
GeneID	`130997140`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997140`
原始查询	`LOC130997140`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0153500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0153500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G09110` (AT3G09110) - identity=34.9; qcov=0.699; evalue=9.93e-11; confidence=low
Rice	`Os01g0153500` - identity=44.8; qcov=0.929; evalue=3.19e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997140

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778383.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778383.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057778383.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778383.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778383.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:3738554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B80,C62
`Chr8:3738622`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B78
`Chr8:3738622`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B78
`Chr8:3738643`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C76
`Chr8:3738643`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C76
`Chr8:3738645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B115
`Chr8:3738647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:3738668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C84
`Chr8:3738705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B120,B132,B31,B73,B90,B92,C75
`Chr8:3738717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:3738751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C84
`Chr8:3738755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778383.1

156 aa

156

DUF674

PF05056 DUF674 3-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778383.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	3	137	7e-18	65.4	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922400.1
ATGTCGGAAACTACGGTGAGCATGAAGCTGTTGGTGGACACGCAAGCCAAGCGAGTCCTGTTCGCGGAGGCCGGCAAGGACTGCGTCGACTTCCTCTTCCACATACTGTCTCTGCCCGTGGCCACCGTGACTGGGCTGCTCAGGGAGGAATCAATGGCGGGATCTTGGCCCAACCTCTACCAAAGCTTAATGGATCTCAACGACGGCTACATACAGCCTAATCAGAGCAGGGACGCCATTCTGACACCGGCGGCGCCGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997140
ATGTCGGAAACTACGGTGAGCATGAAGCTGTTGGTGGACACGCAAGCCAAGCGAGTCCTGTTCGCGGAGGCCGGCAAGGACTGCGTCGACTTCCTCTTCCACATACTGTCTCTGCCCGTGGCCACCGTGACTGGGCTGCTCAGGGAGGAATCAATGGCGGGATCTTGGCCCAACCTCTACCAAAGCTTAATGGATCTCAACGACGGCTACATACAGCCTAATCAGAGCAGGGACGCCATTCTGACACCGGCGGCGCCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778383.1
MSETTVSMKLLVDTQAKRVLFAEAGKDCVDFLFHILSLPVATVTGLLREESMAGSWPNLYQSLMDLNDGYIQPNQSRDAILTPAAPVSGSPVPLLALNDAQIQKEFYDCGVCNDGYVADDPNAVCPKCGALMAAVMDYVAPPAAAEGGGLVKGVVT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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