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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004963`

染色体: Chr08 坐标: 58441206-58443127 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004963`
名称	SmilChr08G004963
描述	60S ribosomal protein L10-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58441206 - 58443127 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997158`
GeneID	`130997158`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997158`
原始查询	`LOC130997158`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L10-like
产物	60S ribosomal protein L10-like
Arabidopsis	`AT1G26910` (RPL10B) Ribosomal protein L16p/L10e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837036] identity=84.9; qcov=0.995; evalue=4.66e-139; confidence=high
Rice	`Os05g0169100` (SG12) - identity=84.9; qcov=1; evalue=2.86e-139; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00252 (Ribosomal_L16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997158

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778400.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778400.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778400.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778400.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58441420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr8:58442064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C65
`Chr8:58442094`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B100,B127,B23,B56,B68,B69,B72,B96,B98,C54,C60,C65,C81,D3
`Chr8:58442107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C86
`Chr8:58442191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B61
`Chr8:58442205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B23,B68,D3
`Chr8:58442205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B68,D3
`Chr8:58442253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:58442311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:58442419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr8:58442437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr8:58442479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B42,C20,C26,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778400.1

252 aa

126

252

Ribosomal_L16

PF00252 Ribosomal_L16 12-166 aa

XP_057778401.1

219 aa

110

219

Ribosomal_L16

PF00252 Ribosomal_L16 12-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778400.1`	Pfam	`PF00252`	Ribosomal_L16	Domain	12	166	2.6e-34	118.7	Ribosomal protein L16p/L10e
`XP_057778401.1`	Pfam	`PF00252`	Ribosomal_L16	Domain	12	166	1.8e-34	119.3	Ribosomal protein L16p/L10e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922417.1
AACATTCAAATATAGCCCTCTTGTAGTTAGCCCAAAAAACAAAGTCAGATCCAGGAAGCTTCTGGGCTCCGTCTAATTGTGTAGCGGCGCCCCATTGACATAATCCAATGCGTAAGCCCACAATCTACCATTTCCTATAAATTCAACAATTTCTCATCCTAAACCCTAATTTTCTCATTCTTCATAGACGGATCAACCACATACAACTCACCATGGGAAGAAGGCCTGCAAGGTGTTACCGTCAAATTAAGAACAATCCG...

XM_057922418.1
AACATTCAAATATAGCCCTCTTGTAGTTAGCCCAAAAAACAAAGTCAGATCCAGGAAGCTTCTGGGCTCCGTCTAATTGTGTAGCGGCGCCCCATTGACATAATCCAATGCGTAAGCCCACAATCTACCATTTCCTATAAATTCAACAATTTCTCATCCTAAACCCTAATTTTCTCATTCTTCATAGACGGATCAACCACATACAACTCACCATGGGAAGAAGGCCTGCAAGGTGTTACCGTCAAATTAAGAACAATCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997158
ATGGGAAGAAGGCCTGCAAGGTGTTACCGTCAAATTAAGAACAATCCGTATCCAAAATCACGGTTCTGCCATGGTGTTCCTGATCCCAAGATCAGAATCTATGATGTGGGTATGAAAAGGAATGGTGTGGATGAATTCCCATTCTGCGTCCACTTGGTCAGTTGGGAGAAGGAAAATGTGTCGAGTGAGGCACTTGAAGCTGCGCGTATTGCGTGTAACAAGTACATGACCAAGTTTGCTGGAAATGATGCTTTCCACTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778400.1
MGRRPARCYRQIKNNPYPKSRFCHGVPDPKIRIYDVGMKRNGVDEFPFCVHLVSWEKENVSSEALEAARIACNKYMTKFAGNDAFHLRVRVHPFHVLRINKMLSCAGADRLQIGMRGAFGKPQGVCARVAIGQVLLSVRCKDNNSQHAQEALHRAKFKFPGRQKIIVSRKWGFTKFNRSDYVRWKSENRIQPDGVNAKVCFLKLQLFFYSKMFMIFSLGCLFVDHVLFILGNFCSFWVVMGDWRTVNQEARF

XP_057778401.1
MGRRPARCYRQIKNNPYPKSRFCHGVPDPKIRIYDVGMKRNGVDEFPFCVHLVSWEKENVSSEALEAARIACNKYMTKFAGNDAFHLRVRVHPFHVLRINKMLSCAGADRLQIGMRGAFGKPQGVCARVAIGQVLLSVRCKDNNSQHAQEALHRAKFKFPGRQKIIVSRKWGFTKFNRSDYVRWKSENRIQPDGVNAKLLGCHGRLANCQPGSAFLTTV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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