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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002535`

染色体: Chr08 坐标: 24599847-24605088 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002535`
名称	SmilChr08G002535
描述	alpha-galactosidase 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	24599847 - 24605088 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997176`
GeneID	`130997176`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997176`
原始查询	`LOC130997176`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-galactosidase 3-like
产物	alpha-galactosidase 3-like
Arabidopsis	`AT3G56310` (AT3G56310) Melibiase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824798] identity=79; qcov=0.762; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0679300` (alpha-Gal) - identity=74.9; qcov=0.772; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00603 (Glycosphingolipid biosynthesis - globo and isoglobo series - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF16499 (Melibiase_2); PF17801 (Melibiase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997176

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057778412.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057778413.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057778412.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778413.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778413.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:24599982`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A2,B10,B113,B115,B14,B15,B24,B41,B54,B57,B70,B76,B78,B83,B90,B94,B97,C1,C15,C47,C5,C6,C62,C68,C76
`Chr8:24602002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,B98,C32
`Chr8:24602643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B56,B96,C22,C4
`Chr8:24602774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778412.1

469 aa

234

469

Melibiase_2

Melibiase_C

PF16499 Melibiase_2 105-368 aa PF17801 Melibiase_C 383-459 aa

XP_057778413.1

500 aa

250

500

Melibiase_2

Melibiase_C

PF16499 Melibiase_2 136-399 aa PF17801 Melibiase_C 414-490 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778412.1`	Pfam	`PF16499`	Melibiase_2	Family	105	368	9.6e-81	271.9	Alpha galactosidase A
`XP_057778412.1`	Pfam	`PF17801`	Melibiase_C	Domain	383	459	3.5e-18	66.2	Alpha galactosidase C-terminal beta sandwich domain
`XP_057778413.1`	Pfam	`PF16499`	Melibiase_2	Family	136	399	1.2e-80	271.6	Alpha galactosidase A
`XP_057778413.1`	Pfam	`PF17801`	Melibiase_C	Domain	414	490	4.1e-18	66.0	Alpha galactosidase C-terminal beta sandwich domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922429.1
CCACTATCGCTATTGCAATAAAAAATTATGCTACAGAAAAAAGAGACGACTACTTATCCAAATAAATTTCTGAGTAAGAAATGGGGTCCAACAACTATGCACAGCACAGTGATTTTTGCGCACAGAAAAAATTATACTATGCTTCGTTGATTTTCTTAAGGGAGAGAAGCAGATATAAGTTGTTACTTGATTGGATGGCGAAGACTGCCAATTATTATTCCATGGCGGTGGGGATTCTTGGAGCAATTGTTTGTGCAAAT...

XM_057922430.1
CTTATCCAAATAAATTTCTGAGTAAGAAATGGGGTCCAACAACTATGCACAGCACAGTGATTTTTGCGCACAGAAAAAATTATACTATGCTTCGTTGATTTTCTTAAGGTTAATATTACCATGCATATATTTCCCACAGCTCAATTTTCCGGCACTTTCTCTCTCTAAGCGTCAGTTTCTTTCTCATATTTATTTATCAAGGGAGAGAAGCAGATATAAGTTGTTACTTGATTGGATGGCGAAGACTGCCAATTATTATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997176
ATGGGGTCCAACAACTATGCACAGCACAGTGATTTTTGCGCACAGAAAAAATTATACTATGCTTCGTTGATTTTCTTAAGGTTAATATTACCATGCATATATTTCCCACAGCTCAATTTTCCGGCACTTTCTCTCTCTAAGCGTCAGTTTCTTTCTCATATTTATTTATCAAGGGAGAGAAGCAGATATAAGTTGTTACTTGATTGGATGGCGAAGACTGCCAATTATTATTCCATGGCGGTGGGGATTCTTGGAGCAAT...

LOC130997176
ATGGGGTCCAACAACTATGCACAGCACAGTGATTTTTGCGCACAGAAAAAATTATACTATGCTTCGTTGATTTTCTTAAGGGAGAGAAGCAGATATAAGTTGTTACTTGATTGGATGGCGAAGACTGCCAATTATTATTCCATGGCGGTGGGGATTCTTGGAGCAATTGTTTGTGCAAATTTGATTTCGGTGGCAGTAAGTGTAAGGATGCTGCCTCTGCATCCTTACTTGAATGGCCAAGAGAAGCCAATTAGTAACAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778412.1
MGSNNYAQHSDFCAQKKLYYASLIFLRERSRYKLLLDWMAKTANYYSMAVGILGAIVCANLISVAVSVRMLPLHPYLNGQEKPISNIYDTSNYGILQLNNGLAKTPQMGWNSWNFFACDINEIVIKETADALVTTGLAKLGYNYVNIDDCWSELVRDSKGQLVPDSKTFPSGIKALADYVHSKGLKLGIYSDAGAFTCQVRPGSIFHESDDAKLFASWGVDYLKYDNCFNLGIPPKERYPPMRDALNATGRSIFYSLCEW...

XP_057778413.1
MGSNNYAQHSDFCAQKKLYYASLIFLRLILPCIYFPQLNFPALSLSKRQFLSHIYLSRERSRYKLLLDWMAKTANYYSMAVGILGAIVCANLISVAVSVRMLPLHPYLNGQEKPISNIYDTSNYGILQLNNGLAKTPQMGWNSWNFFACDINEIVIKETADALVTTGLAKLGYNYVNIDDCWSELVRDSKGQLVPDSKTFPSGIKALADYVHSKGLKLGIYSDAGAFTCQVRPGSIFHESDDAKLFASWGVDYLKYDNCF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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